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Enregistrement W3184993555 · doi:10.3390/metabo11070459

Lipoprotein Proteomics and Aortic Valve Transcriptomics Identify Biological Pathways Linking Lipoprotein(a) Levels to Aortic Stenosis

2021· article· en· W3184993555 sur OpenAlexafffund
Raphaëlle Bourgeois, Jérôme Bourgault, Audrey-Anne Després, Nicolas Perrot, Jakie Guertin, Arnaud Girard, Patricia L. Mitchell, Clarisse Gotti, Sylvie Bourassa, Corey A. Scipione, Nathalie Gaudreault, Michael B. Boffa, Marlys L. Koschinsky, Philippe Pîbarot, Arnaud Droit, Sébastien Thériault, Patrick Mathieu, Yohan Bossé, Benoît J. Arsenault

Notice bibliographique

RevueMetabolites · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac Valve Diseases and Treatments
Établissements canadiensCentre hospitalier universitaire de QuébecRobarts Clinical TrialsUniversity Health NetworkUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésLipoprotein(a)LipoproteinTranscriptomeProteomeAortic valveAortic valve stenosisInflammationStenosisMedicineInternal medicineBiologyGeneBioinformaticsCholesterolGene expressionBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lipoprotein(a) (Lp(a)) is one of the most important risk factors for the development of calcific aortic valve stenosis (CAVS). However, the mechanisms through which Lp(a) causes CAVS are currently unknown. Our objectives were to characterize the Lp(a) proteome and to identify proteins that may be differentially associated with Lp(a) in patients with versus without CAVS. Our second objective was to identify genes that may be differentially regulated by exposure to high versus low Lp(a) levels in explanted aortic valves from patients with CAVS. We isolated Lp(a) from the blood of 21 patients with CAVS and 22 volunteers and performed untargeted label-free analysis of the Lp(a) proteome. We also investigated the transcriptomic signature of calcified aortic valves from patients who underwent aortic valve replacement with high versus low Lp(a) levels (n = 118). Proteins involved in the protein activation cascade, platelet degranulation, leukocyte migration, and response to wounding may be associated with Lp(a) depending on CAVS status. The transcriptomic analysis identified genes involved in cardiac aging, chondrocyte development, and inflammation as potentially influenced by Lp(a). Our multi-omic analyses identified biological pathways through which Lp(a) may cause CAVS, as well as key molecular events that could be triggered by Lp(a) in CAVS development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,469
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,046
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,281 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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