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Enregistrement W3185061635

Melanocortin-1 receptor (MC1R) genotypes do not correlate with size in two cohorts of medium-to-giant congenital melanocytic nevi Institutional affiliations

2020· preprint· en· W3185061635 sur OpenAlexaboutno aff
Neus Calbet‐Llopart, Mirella Pascini‐Garrigos, Gemma Tell‐Martí, Míriam Potrony, Vanessa Martins da Silva, Alicia Barreiro, Susana Puig, Guillaume Captier, Isabelle James, N. Dégardin, Cristina Carrera, Josep Malvehy, Heather Etchevers, Joan Anton Puig‐Butillé

Notice bibliographique

RevueHAL (Le Centre pour la Communication Scientifique Directe) · 2020
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquemelanin and skin pigmentation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMelanocortin 1 receptorGenotypeCongenital melanocytic nevusMedicineDermatologyNevusBiologyGeneticsMelanomaPhenotype
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Congenital melanocytic nevi (CMN) are cutaneous malformations whose prevalence is inversely correlated with projected adult size. CMN are caused by somatic mutations, but epidemiological studies suggest that germline genetic factors may influence CMN development. In CMN patients from the U.K., genetic variants in the MC1R gene, such as p.V92M and loss-of-function variants, have been previously associated with larger CMN. We analyzed the association of MC1R variants with CMN characteristics in 113 medium-to-giant CMN patients from Spain and from a distinct cohort of 53 patients from France, Norway, Canada and the U.S. These cohorts were similar at the clinical and phenotypical level, except for the number of nevi per patient. We found that the p.V92M or loss-of-function MC1R variants either alone or in combination did not correlate with CMN size, in contrast to the U.K. CMN patients. An additional case-control analysis with 259 unaffected Spanish individuals, showed a higher frequency of MC1R compound heterozygous or homozygous variant genotypes in Spanish CMN patients compared to the control population (15.9% vs. 9.3%; P=0.075). Altogether, this study suggests that MC1R variants are not associated with CMN size in these non-U.K. cohorts. Additional studies are required to define the potential role of MC1R as a risk factor in CMN development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2020
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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