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Enregistrement W3185089849 · doi:10.1139/cjps-2021-0039

Pathogenicity, anastomosis groups, host range, and genetic diversity of <i>Rhizoctonia</i> species isolated from soybean, pea, and other crops in Alberta and Manitoba, Canada

2021· article· en· W3185089849 sur OpenAlexafffundvenueabout
Haitian Yu, Qixing Zhou, Sheau‐Fang Hwang, A. Ho, K. F. Chang, Stephen E. Strelkov, Yuhua He, R. L. Conner, Michael W. Harding

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensAgriculture Food and Rural DevelopmentAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaGovernment of CanadaSaskatchewan Pulse Growers
Mots-clésBiologySativumRhizoctoniaPisumRhizoctonia solaniGenetic diversityHost (biology)Field peaCanolaRoot rotVeterinary medicineStem rotPhylogenetic treeHorticultureBotanyAgronomyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Root rot is a common disease in soybean (Glycine max) and field pea (Pisum sativum), which restrain increased production in Canada. Sixty-seven isolates of Rhizoctonia were recovered from various diseased plants in Alberta, Canada along with three isolates from diseased soybean plants in Manitoba, Canada. According to their anastomosis behavior, 23 (32.9%) of the isolates were identified as anastomosis group (AG) 4 (AG4), 7 (10.0%) were AG2-1, 10 (14.3%) were AG2-2, 7 (10.0%) were AG5, 3 (4.3%) were AG-E and the AGs of the remaining 20 (28.6%) isolates could not be determined. Isolates belonging to AG4 produced typical symptoms of stem rot and root rot on seedlings of soybean and pea and were more aggressive than the AG2-1, AG2-2, AG5 and AG-E isolates. Selected isolates of AG4, AG2-1, AG2-2, AG5 and AG-E were to some degree able to infect common crops in Alberta, which included barley, canola, corn, faba bean, flax, lupin, lentil, pea, potato, soybean, and wheat. The genetic variability among these isolates was evaluated using phylogenetic analysis based on the rDNA ITS sequences and inter-simple sequence repeat (ISSR) markers. For the ITS sequence analysis, a neighbour-joining tree was constructed using the PAUP program, which clustered the Rhizoctonia isolates into five groups (Groups I to V). However, no correlation was observed between AGs, locations, aggressiveness or host origins. For the ISSR analysis, 54 polymorphic ISSR patterns were identified, indicating a high level of diversity among the isolates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil0,110

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,159
Écart entre enseignants0,148 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2021
Routes d'admission4
Résumé présentoui

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