MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3185339026 · doi:10.3138/jammi-2020-0043

In vitro susceptibility of common bacterial pathogens causing respiratory tract infections in Canada to lefamulin, a new pleuromutilin

2021· article· en· W3185339026 sur OpenAlexaffvenueabout
Robert M. Taylor, James A. Karlowsky, Melanie Baxter, Heather J. Adam, Andrew Walkty, Philippe Lagacé‐Wiens, George G. Zhanel

Notice bibliographique

RevueJournal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease Canada · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueVeterinary medicine and infectious diseases
Établissements canadiensManitoba HealthUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobiologyStreptococcus pneumoniaeBroth microdilutionHaemophilus influenzaeMoraxella catarrhalisRespiratory tract infectionsMinimum inhibitory concentrationStaphylococcus aureusBiologyBacterial pneumoniaTrimethoprimSulfamethoxazoleAntimicrobialMedicineAntibioticsBacteriaRespiratory systemInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Community-acquired pneumonia (CAP) is a significant global health concern. Pathogens causing CAP demonstrate increasing resistance to commonly prescribed empiric treatments. Resistance in Streptococcus pneumoniae, the most prevalent bacterial cause of CAP, has been increasing worldwide, highlighting the need for improved antibacterial agents. Lefamulin, a novel pleuromutilin, is a recently approved therapeutic agent highly active against many lower respiratory tract pathogens. However, to date minimal data are available to describe the in vitro activity of lefamulin against bacterial isolates associated with CAP. Methods: Common bacterial causes of CAP obtained from both lower respiratory and blood specimen isolates cultured by hospital laboratories across Canada were submitted to the annual CANWARD study’s coordinating laboratory in Winnipeg, Canada, from January 2015 to October 2018. A total of 876 bacterial isolates were tested against lefamulin and comparator agents using the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) reference broth microdilution method, and minimum inhibitory concentrations (MICs) were interpreted using accepted breakpoints. Results: All S. pneumoniae isolates tested from both respiratory (n = 315) and blood specimens (n = 167) were susceptible to lefamulin (MIC ≤0.5 μg/mL), including isolates resistant to penicillins, clarithromycin, doxycycline, and trimethoprim–sulfamethoxazole. Lefamulin also inhibited 99.0% of Haemophilus influenzae isolates (regardless of β-lactamase production) (99 specimens; MIC ≤2 μg/mL) and 95.7% of methicillin-susceptible Staphylococcus aureus (MSSA) (MIC ≤0.25 μg/mL; 70 specimens) at their susceptible breakpoints. Conclusions: Lefamulin demonstrated potent in vitro activity against all respiratory isolates tested and may represent a significant advancement in empiric treatment options for CAP.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,117
Score d'incertitude au seuil0,989

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the Association of Medical Microbiology and Infectious Disease CanadaMême sujetVeterinary medicine and infectious diseasesTravaux en français237 207