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Enregistrement W3185446056 · doi:10.48130/opr-2021-0002

Cloning and Functional Characterization of Chalcone Isomerase Genes Involved in Anthocyanin Biosynthesis in <i>Clivia miniata</i>

2021· article· en· W3185446056 sur OpenAlexaff
Yue Liu, Xinxin Xue, Chunli Zhao, Jia Zhang, Meng Liu, Xiangyu Li, Yueqing Li, Xiang Gao

Notice bibliographique

RevueOrnamental Plant Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Gene Expression Analysis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChalcone isomeraseNaringeninBiochemistryFlavonoid biosynthesisBiologyBiosynthesisFlavonoidGeneChalconeAnthocyaninTransformation (genetics)Molecular biologyChalcone synthaseGene expressionChemistryBotanyStereochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chalcone isomerase (CHI), catalyzing isomerization of chalcones, is a crucial enzyme in flavonoid biosynthesis. Three CHI genes were isolated from Clivia miniata and designated as CmCHI1, CmCHI2 and CmCHI3, respectively. Multiple sequence alignments and phylogenetic analysis showed that CmCHI1 and CmCHI2 were members of type I CHI proteins, whereas CmCHI3 belonged to type IV CHI proteins. Subcellular localization analysis found that all three CmCHIs had diffused distribution in the cytoplasm similar to green fluorescent protein (GFP). Anthocyanin biosynthesis and gene expression analysis demonstrated that CmCHIs were highly expressed in anthocyanin accumulated tissues. To further functionally characterize the role of CmCHIs, an in vitro enzymatic activity assay was carried out using the purified recombinant proteins. Results showed that CmCHI1 and CmCHI2 could completely convert the substrate naringenin chalcone (NC) into the product naringenin (NA), whereas CmCHI3 seemed nonfunctional as no increment of NA was detected. Further genetic transformation of Arabidopsis tt5-1 mutant validated that CmCHI1 and CmCHI2 rather than CmCHI3 could complement the chi deficient phenotypes. In summary, CmCHI1 and CmCHI2 are the real active CHI genes in Clivia miniata. The results not only broaden our knowledge on flavonoid biosynthesis in C. miniata but also lay a new foundation for further flavonoid modification in C. miniata.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,606

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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