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Enregistrement W3185527027 · doi:10.1101/2021.07.29.454121

Optimizing large organ scale micro computed tomography imaging in pig and human hearts using a novel air-drying technique

2021· preprint· en· W3185527027 sur OpenAlexaff
Néstor Pallares‐Lupon, Girish Ramlugun, Valéry Ozenne, Josselin Duchâteau, Anaïs Delgove, Jason D. Bayer, Marion Constantin, Dane Gerneke, Gregory B. Sands, Mark L. Trew, Mélèze Hocini, Michel Haı̈ssaguerre, Edward J. Vigmond, Bruno Quesson, Olivier Bernus, Richard D. Walton

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueAdvanced X-ray and CT Imaging
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesAgence Nationale de la Recherche
Mots-clésX-ray microtomographyBiomedical engineeringComputed tomographyTomographyMaterials scienceMyocyteMedicineRadiologyInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Underlying electrical propagation in the heart and potentially fatal arrhythmia is the cardiac microstructure. Despite the critical role of muscle architecture, a non-destructive approach to examine not only myocyte orientation, but cellular arrangement in to laminar organization is lacking in hearts from translational animal models and humans. X-ray micro computed tomography using contrast enhancing agents achieves three-dimensional images at near-histological resolutions. However, imaging large mammalian hearts presents challenges including X-ray over-attenuation and loss of image contrast. The goal of this study was to rethink tissue pre-treatment to optimize, and benefit from micro computed tomography imaging resolution in large tissues. Whole pig and human hearts were dehydrated and perfused with a tissue reinforcing agent, hexamethyldisilazane, and slowly air-dried. Heart morphology was conserved and temporally stable. This enabled direct air-mounting for micro computed tomography imaging. Moreover, the desiccated tissue density was significantly reduced compared to the initial hydrated state (P=0.04). Three-dimensional image reconstructions of air-dried hearts segmented using a single intensity threshold revealed detailed microstructural architecture of myolaminae. Conversely, one-step segmentation of hearts loaded with contrast agents poorly estimated the gross anatomical morphology of the heart and lacked identification of tissue microarchitecture. Air-drying large mammalian hearts optimizes X-ray imaging of cardiac microstructure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,108
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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