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Enregistrement W3185678440 · doi:10.1038/s42003-021-02418-1

A general mechanism of KCNE1 modulation of KCNQ1 channels involving non-canonical VSD-PD coupling

2021· article· en· W3185678440 sur OpenAlexaff
Xiaoan Wu, Marta E. Perez, Sergei Y. Noskov, H. Peter Larsson

Notice bibliographique

RevueCommunications Biology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCardiac electrophysiology and arrhythmias
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesUniversity of MiamiNational Heart, Lung, and Blood InstituteFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésCoupling (piping)ChemistryBiophysicsMechanism (biology)PhysicsBiologyMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Voltage-gated KCNQ1 channels contain four separate voltage-sensing domains (VSDs) and a pore domain (PD). KCNQ1 expressed alone opens when the VSDs are in an intermediate state. In cardiomyocytes, KCNQ1 co-expressed with KCNE1 opens mainly when the VSDs are in a fully activated state. KCNE1 also drastically slows the opening of KCNQ1 channels and shifts the voltage dependence of opening by >40 mV. We here show that mutations of conserved residues at the VSD-PD interface alter the VSD-PD coupling so that the mutant KCNQ1/KCNE1 channels open in the intermediate VSD state. Using recent structures of KCNQ1 and KCNE beta subunits in different states, we present a mechanism by which KCNE1 rotates the VSD relative to the PD and affects the VSD-PD coupling of KCNQ1 channels in a non-canonical way, forcing KCNQ1/KCNE1 channels to open in the fully-activated VSD state. This would explain many of the KCNE1-induced effects on KCNQ1 channels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,303
Score d'incertitude au seuil0,381

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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