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Enregistrement W3185747415 · doi:10.1080/01621459.2021.1996377

Accelerating Bayesian Structure Learning in Sparse Gaussian Graphical Models

2021· article· en· W3185747415 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Statistical Association · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueBayesian Methods and Mixture Models
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGraphical modelHyperparameterBottleneckAlgorithmComputer scienceGaussianBayesian probabilityWishart distributionScalabilityGraphLaplace's methodMathematicsMathematical optimizationArtificial intelligenceMachine learningTheoretical computer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bayesian structure learning in Gaussian graphical models is often done by search algorithms over the graph space.The conjugate prior for the precision matrix satisfying graphical constraints is the well-known <i>G</i>-Wishart.With this prior, the transition probabilities in the search algorithms necessitate evaluating the ratios of the prior normalizing constants of <i>G</i>-Wishart.In moderate to high-dimensions, this ratio is often approximated by using sampling-based methods as computationally expensive updates in the search algorithm.Calculating this ratio so far has been a major computational bottleneck.We overcome this issue by representing a search algorithm in which the ratio of normalizing constants is carried out by an explicit closed-form approximation.Using this approximation within our search algorithm yields significant improvement in the scalability of structure learning without sacrificing structure learning accuracy.We study the conditions under which the approximation is valid.We also evaluate the efficacy of our method with simulation studies.We show that the new search algorithm with our approximation outperforms state-of-the-art methods in both computational efficiency and accuracy.The implementation of our work is available in the R package BDgraph.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,569
Score d'incertitude au seuil0,384

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle