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Enregistrement W3185750282 · doi:10.1371/journal.pcbi.1009238

Ten simple rules for conducting a mendelian randomization study

2021· editorial· en· W3185750282 sur OpenAlex
Sarah A. Gagliano Taliun, David M. Evans

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePLoS Computational Biology · 2021
Typeeditorial
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Heart Institute
Organismes subventionnairesNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilFonds de Recherche du Québec - SantéInstitut de Valorisation des DonnéesUniversity of Bristol
Mots-clésMendelian randomizationConfoundingCausal inferenceInstrumental variableObservational studyAlleleProxy (statistics)GeneticsOutcome (game theory)BiologyStatisticsGeneMathematicsGenetic variantsGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mendelian randomization (MR) is an epidemiological technique for estimating causal relationships using observational data, which has become very popular in recent years following publication of a seminal article by Smith and Ebrahim in 2003 [1]. MR is a specific form of “instrumental variables” (IV) analysis (the latter being first invented by Phillip and Sewall Wright in the 1920s [2]) that uses genetic variants to proxy a modifiable variable (which we term the “exposure” variable here) in order to estimate the causal relationship between the exposure and an outcome of interest. To understand how this causal inference technique works, it is useful to think of MR as similar to a “natural” randomized controlled trial [3] where individuals are randomly assigned to groups based on the alleles that they inherit from their parents (Fig 1). MR takes advantage of Mendel’s laws of segregation and independent assortment, which state that offspring inherit alleles randomly from their parents and randomly with respect to other genes in the genome (with certain exceptions [1]). Therefore, genetic variants that are related to an exposure of interest can be used to proxy the part of the exposure variable that is independent of possible confounding influences from the environment and other traits. Providing several assumptions are satisfied (see below), and the principle of gene–environment equivalence (i.e., perturbing the exposure genetically has the same effect as perturbing the exposure by other means), statistical association between the genetic variant and the outcome is indicative of a causal relationship between the exposure and the outcome and can be used to estimate the magnitude of the causal relationship using IV methods. Although originally developed as a way to estimate causal relationships between modifiable environmental exposures and medically relevant outcomes, in recent years, MR has been utilized in many other situations including studies of molecular biomarkers, in pharmacogenetics, in the social sciences, and in other discplines that use observational frameworks [4,5]. Open in a separate window Fig 1 Similarities between the MR study design and a randomized controlled trial. MR, mendelian randomization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,160
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle