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Enregistrement W3186110962 · doi:10.1093/biolinnean/blab090

Molecular phylogeny for the Neotropical freshwater stingrays (Myliobatiformes: Potamotrygoninae) reveals limitations of traditional taxonomy

2021· article· en· W3186110962 sur OpenAlexaff
João Pedro Fontenelle, Nathan R. Lovejoy, Matthew A. Kolmann, Fernando P. L. Marques

Notice bibliographique

RevueBiological Journal of the Linnean Society · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueFish biology, ecology, and behavior
Établissements canadiensThe Scarborough HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesInstituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais RenováveisConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoFundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São PauloRufford FoundationWorld Wildlife Fund
Mots-clésBiologyMonophylyCladeTaxonomy (biology)ZoologyEcologyPhylogenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The subfamily Potamotrygoninae, the only extant clade of elasmobranchs exclusive to freshwater environments, encompasses four genera and 38 species distributed across almost every major South American river basin. Despite their importance in the ornamental fish trade, the taxonomy and evolutionary relationships within potamotrygonines have not yet been resolved. Here, we present a comprehensive molecular phylogeny for the Neotropical freshwater stingrays, based on extensive species and population sampling (35 species and > 350 individuals from drainages across South America). Our phylogeny corroborates the monophyly of the genera Paratrygon and Heliotrygon and the monophyly of the Potamotrygon + Plesiotrygon clade. Within the Potamotrygon + Plesiotrygon clade, we identify a core Potamotrygon clade characterized by short branches, low nodal support and incongruence with current species-level taxonomy. In the core Potamotrygon clade, specimens of widespread species, such as Potamotrygon motoro and Potamotrygon orbignyi, do not form monophyletic lineages; instead, specimens from these species are often closely related to those of other species from the same river basins. These patterns could be caused by inaccurate taxonomy, hybridization, incomplete lineage sorting and rapid diversification. We discuss the conservation of Neotropical freshwater stingrays from a phylogenetic perspective and suggest ways to prioritize potamotrygonid conservation efforts with respect to endemism and evolutionary distinctiveness.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,716
Score d'incertitude au seuil0,454

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,120
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,136 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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