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Enregistrement W3186238632 · doi:10.3390/molecules26154538

Interstrain Variability of Human Vaginal Lactobacillus crispatus for Metabolism of Biogenic Amines and Antimicrobial Activity against Urogenital Pathogens

2021· article· en· W3186238632 sur OpenAlexaff
Scarlett Puebla-Barragan, Emiley Watson, Charlotte van der Veer, John A. Chmiel, Charles Carr, Jeremy P. Burton, Mark W. Sumarah, Remco Kort, Gregor Reid

Notice bibliographique

RevueMolecules · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueReproductive tract infections research
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesConsejo Nacional de Ciencia y Tecnología
Mots-clésLactobacillus crispatusBiologyMicrobiologyProbioticAntimicrobialLactobacillusCadaverineDysbiosisBacteriaFood scienceGut floraPutrescineFermentationBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lactobacillus crispatus is the dominant species in the vagina of many women. With the potential for strains of this species to be used as a probiotic to help prevent and treat dysbiosis, we investigated isolates from vaginal swabs with Lactobacillus-dominated and a dysbiotic microbiota. A comparative genome analysis led to the identification of metabolic pathways for synthesis and degradation of three major biogenic amines in most strains. However, targeted metabolomic analysis of the production and degradation of biogenic amines showed that certain strains have either the ability to produce or to degrade these compounds. Notably, six strains produced cadaverine, one produced putrescine, and two produced tyramine. These biogenic amines are known to raise vaginal pH, cause malodour, and make the environment more favourable to vaginal pathogens. In vitro experiments confirmed that strains isolated from women with a dysbiotic vaginal microbiota have higher antimicrobial effects against the common urogenital pathogens Escherichia coli and Enterococcus faecium. The results indicate that not all L. crispatus vaginal strains appear suitable for probiotic application and the basis for selection should not be only the overall composition of the vaginal microbiota of the host from which they came, but specific biochemical and genetic traits.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,061
Score d'incertitude au seuil0,636

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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