MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3186356832 · doi:10.82308/41957

Insights into the molecular role of Progranulin: lessons learnt from small model organisms

2021· article· en· W3186356832 sur OpenAlexfundno aff
James-Julian Doyle

Notice bibliographique

RevueeScholarship@McGill (McGill) · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyComputational biologyComputer scienceEvolutionary biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Progranulin (PGRN) is a broadly expressed trophic factor in which loss-of-function mutations lead to Frontotemporal dementia (FTD), a devastating neurodegenerative disease with no known cure or therapy. PGRN has been shown to regulate a number of cellular functions, one of which is lysosomal function. However, the mechanistic link between the two remains unclear. Here, we have turned to the nematode, Caenorhabditis elegans, to better understand the cellular and molecular disturbances that lead to PGRN pathologies and as a drug screening tool to identify new, potential therapies for this disease.In our search for a link between PGRN and lysosomal function, we have found that many enzymes in the sphingolipid (SL) biosynthetic pathway appear to be important. We demonstrate that the RNAi knockdown of multiple genes involved in SL metabolism restore lysosomal defects in nematodes in vivo. Interestingly, the knockdown of some of these enzymes also restore other phenotypes, such as autophagy and motility, to WT levels suggesting an important role for SLs in PGRN pathology. This was especially true for cgt-3 and asah-1, the worm homologs of the mammalian enzymes UGCG and ASAH1 respectively, whose knockdowns restored all tested phenotypes. We further used these nematodes as an in vivo tool for an unbiased, high-throughput drug screen and validated our hits in PGRN-deficient cells. We identified two promising drug candidates, rottlerin and rivastigmine, that were able to restore WT levels of many phenotypes in the nematodes, both individually and in combination.Our work not only provides important insight into PGRN’s function, but presents two promising drug candidates deserving of further testing, opens to door to other therapeutic avenues, and helps identify broader indications for them, beyond FTD

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,003
Communication savante0,0010,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueeScholarship@McGill (McGill)→Même sujetAmyotrophic Lateral Sclerosis Research→Travaux en français237 207→