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Enregistrement W3186435170 · doi:10.3390/ijms22157835

Muscular and Molecular Pathology Associated with SPATA5 Deficiency in a Child with EHLMRS

2021· article· en· W3186435170 sur OpenAlexaff
Frederik Braun, Andreas Hentschel, Albert Sickmann, Theodore Marteau, Swantje Hertel, Fabian Förster, Holger Prokisch, Matias Wagner, Saskia B. Wortmann, Adela Della Marina, Heike Kölbel, Andreas Roos, Ulrike Schara‐Schmidt

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesBundesministerium für Bildung und ForschungEuropean Regional Development FundFrench Muscular Dystrophy Association
Mots-clésMuscle biopsyMolecular pathologyPathologyBiologyPathologicalBiopsyPhenotypeMyopathyMitochondrial diseaseMuscle disorderMedicineGeneticsGeneInternal medicineMitochondrial DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in the SPATA5 gene are associated with epilepsy, hearing loss and mental retardation syndrome (EHLMRS). While SPATA5 is ubiquitously expressed and is attributed a role within mitochondrial morphogenesis during spermatogenesis, there is only limited knowledge about the associated muscular and molecular pathology. This study reports on a comprehensive workup of muscular pathology, including proteomic profiling and microscopic studies, performed on an 8-year-old girl with typical clinical presentation of EHLMRS, where exome analysis revealed two clinically relevant, compound-heterozygous variants in SPATA5. Proteomic profiling of a quadriceps biopsy showed the dysregulation of 82 proteins, out of which 15 were localized in the mitochondrion, while 19 were associated with diseases presenting with phenotypical overlap to EHLMRS. Histological staining of our patient’s muscle biopsy hints towards mitochondrial pathology, while the identification of dysregulated proteins attested to the vulnerability of the cell beyond the mitochondria. Through our study we provide insights into the molecular etiology of EHLMRS and provide further evidence for a muscle pathology associated with SPATA5 deficiency, including a pathological histochemical pattern accompanied by dysregulated protein expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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