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Enregistrement W3186471366 · doi:10.3389/fmicb.2021.651279

Endomembrane-Targeting Plasmodiophora brassicae Effectors Modulate PAMP Triggered Immune Responses in Plants

2021· article· en· W3186471366 sur OpenAlexafffund
Md Musharaf Hossain, Edel Pérez‐López, Christopher D. Todd, Yangdou Wei, Peta C. Bonham‐Smith

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Microbiology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensUniversité LavalUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesSaskatchewan Canola Development CommissionMinistry of Agriculture - Saskatchewan
Mots-clésBiologyEndomembrane systemCell biologyEffectorHypersensitive responseArabidopsisFlagellinEndoplasmic reticulumProgrammed cell deathGolgi apparatusBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Plasmodiophora brassicae is a devastating obligate, intracellular, biotrophic pathogen that causes clubroot disease in crucifer plants. Disease progression is regulated by effector proteins secreted by P. brassicae. Twelve P. brassicae putative effectors (PbPEs), expressed at various stages of disease development [0, 2, 5, 7, 14, 21, and 28 days post inoculation (DPI)] in Arabidopsis and localizing to the plant endomembrane system, were studied for their roles in pathogenesis. Of the 12 PbPEs, seven showed an inhibitory effect on programmed cell death (PCD) as triggered by the PCD inducers, PiINF1 (Phytophthora infestans Infestin 1) and PiNPP1 (P. infestans necrosis causing protein). Showing the strongest level of PCD suppression, PbPE15, a member of the 2-oxoglutarate (2OG) and Fe (II)-dependent oxygenase superfamily and with gene expression during later stages of infection, appears to have a role in tumorigenesis as well as defense signaling in plants. PbPE13 produced an enhanced PiINF1-induced PCD response. Transient expression, in Nicotiana benthamiana leaves of these PbPEs minus the signal peptide (SP) (ΔspPbPEGFPs), showed localization to the endomembrane system, targeting the endoplasmic reticulum (ER), Golgi bodies and nucleo-cytoplasm, suggesting roles in manipulating plant cell secretion and vesicle trafficking. ΔspPbPE13GFP localized to plasma membrane (PM) lipid rafts with an association to plasmodesmata, suggesting a role at the cell-to-cell communication junction. Membrane relocalization of ΔspPbPE13GFP, triggered by flagellin N-terminus of Pseudomonas aeruginosa (flg22 – known to elicit a PAMP triggered immune response in plants), supports its involvement in raft-mediated immune signaling. This study is an important step in deciphering P. brassicae effector roles in the disruption of plant immunity to clubroot disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations38
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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