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Enregistrement W3186831836 · doi:10.1111/epi.17002

Patient specific prediction of temporal lobe epilepsy surgical outcomes

2021· article· en· W3186831836 sur OpenAlexaffabout
Marco Benjumeda, Yee‐Leng Tan, Karina A. González Otárula, Dharshan Chandramohan, Edward F. Chang, Jeffery A. Hall, Concha Bielza, Pedro Larrañaga, Eliane Kobayashi, Robert C. Knowlton

Notice bibliographique

RevueEpilepsia · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEpilepsy research and treatment
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesHorizon 2020 Framework ProgrammeMinisterio de Ciencia e InnovaciónFundación BBVA
Mots-clésTemporal lobeEpilepsyLogistic regressionReceiver operating characteristicEpilepsy surgeryProbabilistic logicArtificial intelligenceMedicineComputer scienceStatisticsPsychologyMachine learningMathematicsPsychiatry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVE: Drug-resistant temporal lobe epilepsy (TLE) is the most common type of epilepsy for which patients undergo surgery. Despite the best clinical judgment and currently available prediction algorithms, surgical outcomes remain variable. We aimed to build and to evaluate the performance of multidimensional Bayesian network classifiers (MBCs), a type of probabilistic graphical model, at predicting probability of seizure freedom after TLE surgery. METHODS: Clinical, neurophysiological, and imaging variables were collected from 231 TLE patients who underwent surgery at the University of California, San Francisco (UCSF) or the Montreal Neurological Institute (MNI) over a 15-year period. Postsurgical Engel outcomes at year 1 (Y1), Y2, and Y5 were analyzed as primary end points. We trained an MBC model on combined data sets from both institutions. Bootstrap bias corrected cross-validation (BBC-CV) was used to evaluate the performance of the models. RESULTS: The MBC was compared with logistic regression and Cox proportional hazards according to the area under the receiver-operating characteristic curve (AUC). The MBC achieved an AUC of 0.67 at Y1, 0.72 at Y2, and 0.67 at Y5, which indicates modest performance yet superior to what has been reported in the state-of-the-art studies to date. SIGNIFICANCE: The MBC can more precisely encode probabilistic relationships between predictors and class variables (Engel outcomes), achieving promising experimental results compared to other well-known statistical methods. Multisite application of the MBC could further optimize its classification accuracy with prospective data sets. Online access to the MBC is provided, paving the way for its use as an adjunct clinical tool in aiding pre-operative TLE surgical counseling.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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