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Enregistrement W3186961738 · doi:10.1101/2021.07.24.453638

Unraveling the regulatory role of miRNAs responsible for proanthocyanidin biosynthesis in the underutilized legume <i>Psophocarpus tetragonolobus</i> (L.) DC

2021· preprint· en· W3186961738 sur OpenAlexaff
Sagar Nayak, Priti Prasad, Vinayak Singh, Abhinandan Mani Tripathi, Sumit Kumar Bag, Chandra Sekhar Mohanty

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProanthocyanidinBiologyTanninLegumeCatechinBiosynthesisPolyphenolBiochemistryFood sciencemicroRNABotanyGeneAntioxidant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The underutilized legume winged bean ( Psophocarpus tetragonolobus (L.) DC.) is deposited with various degrees of proanathocyanidin (PA) or condensed tannin (CT) on its seed-coat. PA content of two different lines of P. tetragonolobus was estimated and accordingly they were denoted as high-proanthocyanidin containing winged bean (HPW) and low-proanthocyanidin containing winged bean (LPW). The level of PA-content varied as 59.23 mg/g in HPW and 8.68 mg/g in LPW when estimated through vanillin-HCl assay. The identification and quantification of catechin and epigallocatechin gallate were estimated in a range of 63.8 mg/g and 2.3mg/g respectively in HPW whereas only epigallocatechin gallate was reported in LPW line with a value of 3 mg/g. A comparative miRNA profiling of the leaf-tissues of these contrasting lines of P. tetragonolobus revealed a total of 139 mature miRNAs. Isoforms of known novel miRNAs were also identified in this study. Differentially expressed miRNAs e.g., miR156, miR396, miR4414b, miR4416c, miR894, miR2111 and miR5139 were validated through qRT-PCR analysis. Target prediction of the identified miRNAs especially miR156, miR396, miR4416b shows that they have a potential role in the proanthocyanidin biosynthesis of P. tetragonolobus . The study will provide the basis for understanding the role of miRNAs in regulating the biosynthesis of proanthocyanidin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,202 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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