Unraveling the regulatory role of miRNAs responsible for proanthocyanidin biosynthesis in the underutilized legume <i>Psophocarpus tetragonolobus</i> (L.) DC
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The underutilized legume winged bean ( Psophocarpus tetragonolobus (L.) DC.) is deposited with various degrees of proanathocyanidin (PA) or condensed tannin (CT) on its seed-coat. PA content of two different lines of P. tetragonolobus was estimated and accordingly they were denoted as high-proanthocyanidin containing winged bean (HPW) and low-proanthocyanidin containing winged bean (LPW). The level of PA-content varied as 59.23 mg/g in HPW and 8.68 mg/g in LPW when estimated through vanillin-HCl assay. The identification and quantification of catechin and epigallocatechin gallate were estimated in a range of 63.8 mg/g and 2.3mg/g respectively in HPW whereas only epigallocatechin gallate was reported in LPW line with a value of 3 mg/g. A comparative miRNA profiling of the leaf-tissues of these contrasting lines of P. tetragonolobus revealed a total of 139 mature miRNAs. Isoforms of known novel miRNAs were also identified in this study. Differentially expressed miRNAs e.g., miR156, miR396, miR4414b, miR4416c, miR894, miR2111 and miR5139 were validated through qRT-PCR analysis. Target prediction of the identified miRNAs especially miR156, miR396, miR4416b shows that they have a potential role in the proanthocyanidin biosynthesis of P. tetragonolobus . The study will provide the basis for understanding the role of miRNAs in regulating the biosynthesis of proanthocyanidin.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».