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Enregistrement W3187062000 · doi:10.1093/jac/dkab180

Analysing the trend over time of antibiotic consumption in the community: a tutorial on the detection of common change-points

2021· article· en· W3187062000 sur OpenAlexaboutno aff
Robin Bruyndonckx, Samuel Coenen, Niels Adriaenssens, Ann Versporten, Dominique L. Monnet, Herman Goossens, Geert Molenberghs, Klaus Weist, Niel Hens, Reinhild Strauß, Eline Vandael, Stefana Sabtcheva, Marina Payerl-Pal, Isavella Kyriakidou, Jiřı́ Vlček, Ute Wolff Sönksen, Elviira Linask, Emmi Sarvikivi, Philippe Cavalié, Tim Eckmanns, Flora Kontopidou, Mária Matúz, Gudrun Aspelund, Karen Burns, Filomena Fortinguerra, Andis Seilis, Rolanda Valintėlienė, Marcel Bruch, Peter Zarb, Stephanie Natsch, Hege Salvesen Blix, Anna Olczak-Pieńkowska, Ana Silva, Gabriel Adrian Popescu, Tomáš Tesař, Milan Čižman, Antonio López Navas, Vendela Bergfeldt, Berit Müller‐Pebody

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntibiotic Use and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversiteit AntwerpenFonds Wetenschappelijk OnderzoekEuropean Centre for Disease Prevention and ControlGlaxoSmithKlineVlaamse regeringPfizer
Mots-clésConsumption (sociology)Quarter (Canadian coin)Index (typography)Set (abstract data type)Data setComputer scienceEconometricsOperations researchStatisticsGeographyMathematicsArtificial intelligenceSocial scienceSociology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: This tutorial describes and illustrates statistical methods to detect time trends possibly including abrupt changes (referred to as change-points) in the consumption of antibiotics in the community. METHODS: For the period 1997-2017, data on consumption of antibacterials for systemic use (ATC group J01) in the community, aggregated at the level of the active substance, were collected using the WHO ATC/DDD methodology and expressed in DDD (ATC/DDD index 2019) per 1000 inhabitants per day. Trends over time and presence of common change-points were studied through a set of non-linear mixed models. RESULTS: After a thorough description of the set of models used to assess the time trend and presence of common change-points herein, the methodology was applied to the consumption of antibacterials for systemic use (ATC J01) in 25 EU/European Economic Area (EEA) countries. The best fit was obtained for a model including two change-points: one in the first quarter of 2004 and one in the last quarter of 2008. CONCLUSIONS: Allowing for the inclusion of common change-points improved model fit. Individual countries investigating changes in their antibiotic consumption pattern can use this tutorial to analyse their country data.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,285

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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