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Enregistrement W3187063758 · doi:10.2196/24651

Candidemia Risk Prediction (CanDETEC) Model for Patients With Malignancy: Model Development and Validation in a Single-Center Retrospective Study

2021· article· en· W3187063758 sur OpenAlexvenueno aff
Junsang Yoo, Si‐Ho Kim, Sujeong Hur, Juhyung Ha, Kyungmin Huh, Won Chul

Notice bibliographique

RevueJMIR Medical Informatics · 2021
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacovigilance and Adverse Drug Reactions
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesKorea Health Industry Development Institute
Mots-clésMedicineRandom forestRetrospective cohort studyReceiver operating characteristicLogistic regressionMachine learningArtificial intelligenceCancerInternal medicineAlgorithmComputer science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Appropriate empirical treatment for candidemia is associated with reduced mortality; however, the timely diagnosis of candidemia in patients with sepsis remains poor. OBJECTIVE: We aimed to use machine learning algorithms to develop and validate a candidemia prediction model for patients with cancer. METHODS: We conducted a single-center retrospective study using the cancer registry of a tertiary academic hospital. Adult patients diagnosed with malignancies between January 2010 and December 2018 were included. Our study outcome was the prediction of candidemia events. A stratified undersampling method was used to extract control data for algorithm learning. Multiple models were developed-a combination of 4 variable groups and 5 algorithms (auto-machine learning, deep neural network, gradient boosting, logistic regression, and random forest). The model with the largest area under the receiver operating characteristic curve (AUROC) was selected as the Candida detection (CanDETEC) model after comparing its performance indexes with those of the Candida Score Model. RESULTS: From a total of 273,380 blood cultures from 186,404 registered patients with cancer, we extracted 501 records of candidemia events and 2000 records as control data. Performance among the different models varied (AUROC 0.771- 0.889), with all models demonstrating superior performance to that of the Candida Score (AUROC 0.677). The random forest model performed the best (AUROC 0.889, 95% CI 0.888-0.889); therefore, it was selected as the CanDETEC model. CONCLUSIONS: The CanDETEC model predicted candidemia in patients with cancer with high discriminative power. This algorithm could be used for the timely diagnosis and appropriate empirical treatment of candidemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,948
Score d'incertitude au seuil0,688

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,380
Écart entre enseignants0,316 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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