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Enregistrement W3188045923 · doi:10.1038/s41467-021-25113-5

Mortality in individuals treated with COVID-19 convalescent plasma varies with the geographic provenance of donors

2021· article· en· W3188045923 sur OpenAlexfundno aff
Katie L. Kunze, Patrick W. Johnson, Noud van Helmond, Jonathon W. Senefeld, M. Petersen, Stephen A. Klassen, Chad C. Wiggins, Allan M. Klompas, Katelyn A. Bruno, John R. Mills, Elitza S. Theel, Matthew Buras, Michael A. Golafshar, Matthew A. Sexton, Juan C. Diaz Soto, Sarah E. Baker, John R.A. Shepherd, Nicole Verdun, Peter Marks, Nigel Paneth, DeLisa Fairweather, R. Scott Wright, Camille M. van Buskirk, Jeffrey L. Winters, James R. Stubbs, Katherine A. Senese, Michaela C. Pletsch, Zachary A. Buchholtz, Robert F. Rea, Vitaly Herasevich, Emily R. Whelan, Andrew J. Clayburn, Kathryn F. Larson, Juan G. Ripoll, Kylie J. Andersen, Elizabeth R. Lesser, Matthew N.P. Vogt, Joshua J. Dennis, Riley J. Regimbal, Philippe R. Bauer, Janis E. Blair, Arturo Casadevall, Rickey E. Carter, Michael J. Joyner

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute on AgingNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesMayo ClinicNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBiomedical Advanced Research and Development AuthorityNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Heart, Lung, and Blood InstituteTakeda OncologyU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésConvalescent plasmaCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Immune systemMedicineVirologyAntibodyImmunology2019-20 coronavirus outbreakCoronavirusDiseaseInternal medicineInfectious disease (medical specialty)Outbreak

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Successful therapeutics and vaccines for coronavirus disease 2019 (COVID-19) have harnessed the immune response to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Evidence that SARS-CoV-2 exists as locally evolving variants suggests that immunological differences may impact the effectiveness of antibody-based treatments such as convalescent plasma and vaccines. Considering that near-sourced convalescent plasma likely reflects the antigenic composition of local viral strains, we hypothesize that convalescent plasma has a higher efficacy, as defined by death within 30 days of transfusion, when the convalescent plasma donor and treated patient were in close geographic proximity. Results of a series of modeling techniques applied to approximately 28,000 patients from the Expanded Access to Convalescent Plasma program (ClinicalTrials.gov number: NCT04338360) support this hypothesis. This work has implications for the interpretation of clinical studies, the ability to develop effective COVID-19 treatments, and, potentially, for the effectiveness of COVID-19 vaccines as additional locally-evolving variants continue to emerge.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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