<i>Escherichia coli</i> bloodstream infections in the western interior of British Columbia, Canada: a population-based cohort study
Notice bibliographique
Résumé
Our population-based study objectives were to describe characteristics and outcomes of Escherichia coli bloodstream infections (BSIs), and to evaluate factors associated with outcomes. We included incident E. coli BSIs from western interior residents (British Columbia, Canada; 04/2010-03/2020). We obtained data including patient demographics, location of onset, infection focus, Charlson comorbidity index (CCI), antimicrobial resistance, 30-day all-cause mortality and length of hospital stay (LOS). Using multivariable logistic regression models fitted with generalised estimating equations, we estimated factors associated with 30-day mortality and long post-infection LOS (>75th percentile). We identified 1080 incident E. coli BSIs in 1009 patients. The crude incidence and 30-day mortality rates were 59.1 BSIs and 6.8 deaths/100 000 person-years, respectively. The 30-day case fatality risk was 11.5%. Compared to community-acquired E. coli BSIs, either healthcare-associated or nosocomial cases had higher odds of 30-day mortality. Older cases, non-urogenital BSI foci and CCI ⩾ 3 had higher odds of 30-day mortality compared to younger cases, urogenital foci and CCI < 3. In patients that survived to discharge, those with extended-spectrum β-lactamase (ESBL)-producing E. coli BSIs, nosocomial BSIs, and CCI ⩾ 3 had higher odds of long post-infection LOS compared to those with non-ESBL-producing, community-acquired and healthcare-associated, and CCI < 3. There is a substantial disease burden from E. coli BSIs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».