Identification of the telemorph Mycosphaerella graminicola in Manitoba by direct observation and molecular polymorphism
Notice bibliographique
Résumé
Mycosphaerella graminicola (Fuckel) J. Schrot. in Cohn causes speckled leaf blotch (septoria leaf blotch) in wheat, a major leaf-spotting disease found in many wheat-growing regions. The sexual structures of M. graminicola were identified in wheat stubble during the summer of 2001 in Carman, Manitoba. Ascospores were isolated from pseudothecia and formed conidial colonies similar to the pycnidiospores of Septoria tritici Roberge in Desmaz., the asexual state, on agar medium. Wheat plants inoculated with conidia derived from ascospore isolates developed symptoms typical of speckled leaf blotch. The pathogen was reisolated and budding conidial colonies identical to those produced by the germination of the ascospores were obtained. This represents the first time that the teleomorph M. graminicola was identified by direct observation in Canada. Amplified fragment length polymorphism (AFLP) was the molecular marker system used to indirectly identify the sexual state, and the objective was to detect polymorphism among M. graminicola isolates due to sexual recombination. Isolates from Manitoba field locations at Carman and Minnedosa were collected using a hierarchical procedure and were divided into two separate sets. Set I consisted of 44 isolates representing the two field locations and different stations within each of the fields. Set II was a control test, with 42 isolates representing single spores and their respective pycnidia picked from different leaves and lesions at one station in each of Carman and Minnedosa. Both Set I and II AFLP banding patterns showed polymorphism among isolates and no distinct clustering of populations was observed in the dendrograms. Analysis of molecular variance (AMOVA) of Set I revealed that 99.02% (P<0.05) of the total genetic diversity was due to within population variation and 0.98% to between population variation. This uniform pattern of inoculum distribution within fields suggests that wind-blown ascospores are present in Manitoba and contribute significantly to speckled leaf blotch epidemics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».