Complete mitochondrial genome of the harmful algal bloom species <i>Pseudo-nitzschia delicatissima</i> (Bacillariophyceae, Bacillariophyta)
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Notice bibliographique
Résumé
Pseudo-nitzschia is an important genus of diatoms with many species capable of inducing harmful algae blooms (HABs) in coastal and oceanic waters, some of which produce the toxin domoic acid (DA), a neurotoxin that causes amnesic shellfish poisoning (ASP). Pseudo-nitzschia delicatissima is a cosmopolitan species that can induce HABs and produce DA. Nevertheless, mitochondrial genome of P. delicatissima has not been revealed. In this study, we determined the complete mitochondrial genome of P. delicatissima for the first time. The circular mitochondrial genome was 42,182 bp in length with GC content of 30.37%. It consisted of 65 genes including 39 protein-coding genes (PCGs), 24 tRNA genes, and two rRNA genes. This mitogenome has a group II intron, located in the cytochrome c oxidase subunit genes (cox1), with orf790 identified inside the intron region. Phylogenetic analysis revealed that P. delicatissima was clustered well with P. multiseries. This analysis is valuable for studying the evolutionary relationships among Pseudo-nitzschia species, and for comparative analysis of P. delicatissima strains.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,013 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle