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Enregistrement W3189773485 · doi:10.7554/elife.68174

Non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor-based combination antiretroviral therapy is associated with lower cell-associated HIV RNA and DNA levels compared to protease inhibitor-based therapy

2021· article· en· W3189773485 sur OpenAlexaff
Alexander Pasternak, Jelmer Vroom, Neeltje A. Kootstra, Ferdinand W.N.M. Wit, Marijn de Bruin, Davide De Francesco, Margreet Bakker, Caroline Sabin, Alan Winston, Jan M. Prins, Peter Reiss, Ben Berkhout, J. Schouten, KW Kooij, RA van Zoest, B C Elsenga, F R Janssen, M. Heidenrijk, W Zikkenheiner, Marc van der Valk, Thijs Booiman, A M Harskamp-Holwerda, Irma Maurer, MM Mangas Ruiz, AF Girigorie, Julien Villaudy, Esmay Frankin, AO Pasternak, T van der Kuyl, Peter Portegies, BA Schmand, Gert J. Geurtsen, JA ter Stege, M. Klein Twennaar, CBLM Majoie, MWA Caan, Tanja Su, Kees Weijer, P H L T Bisschop, Andries Kalsbeek, M Wezel, I. Visser, HG Ruhé, Claudio Franceschi, Paolo Garagnani, Chiara Pirazzini, Miriam Capri, Fabio Dall’Olio, Mariella Chiricolo, Stefano Salvioli, Jan H.J. Hoeijmakers, Joris Pothof, M Martens, Solange Moll, J Berkel, M Totté, Sergey Y. Kovalev, Magnus Gisslén, D. Fuchs, Henrik Zetterberg, Jonathan Underwood, L McDonald, Matthew A. Stott, Ken Legg, Andrew Lovell, Otto Erlwein, Nicki Doyle, Cherry Kingsley, DJ Sharp, Robert Leech, J. F. Cole, S Zaheri, M M J Hillebregt, Y M C Ruijs, D P Benschop, David M. Burger, M de Graaff-Teulen, Giovanni Guaraldi, Alexander Bürkle, Thilo Sindlinger, María Moreno‐Villanueva, Amy Keller, Claude Libert, Sylviane Dewaele

Notice bibliographique

RevueeLife · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS drug development and treatment
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesFP7 HealthMedical Research CouncilUniversiteit van AmsterdamEuropean CommissionZonMwNational Institute for Health and Care ResearchAmsterdam University Medical Centers
Mots-clésReverse transcriptaseNucleoside Reverse Transcriptase InhibitorNevirapineReverse-transcriptase inhibitorProtease inhibitor (pharmacology)RNAVirologyNucleosideViral loadRegimenBiologyMedicineVirusAntiretroviral therapyInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: It remains unclear whether combination antiretroviral therapy (ART) regimens differ in their ability to fully suppress human immunodeficiency virus (HIV) replication. Here, we report the results of two cross-sectional studies that compared levels of cell-associated (CA) HIV markers between individuals receiving suppressive ART containing either a non-nucleoside reverse transcriptase inhibitor (NNRTI) or a protease inhibitor (PI). Methods: CA HIV unspliced RNA and total HIV DNA were quantified in two cohorts (n = 100, n = 124) of individuals treated with triple ART regimens consisting of two nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NRTIs) plus either an NNRTI or a PI. To compare CA HIV RNA and DNA levels between the regimens, we built multivariable models adjusting for age, gender, current and nadir CD4 + count, plasma viral load zenith, duration of virological suppression, NRTI backbone composition, low-level plasma HIV RNA detectability, and electronically measured adherence to ART. Results: In both cohorts, levels of CA HIV RNA and DNA strongly correlated (rho = 0.70 and rho = 0.54) and both markers were lower in NNRTI-treated than in PI-treated individuals. In the multivariable analysis, CA RNA in both cohorts remained significantly reduced in NNRTI-treated individuals (p adj = 0.02 in both cohorts), with a similar but weaker association between the ART regimen and total HIV DNA (p adj = 0.048 and p adj = 0.10). No differences in CA HIV RNA or DNA levels were observed between individual NNRTIs or individual PIs, but CA HIV RNA was lower in individuals treated with either nevirapine or efavirenz, compared to PI-treated individuals. Conclusions: All current classes of antiretroviral drugs only prevent infection of new cells but do not inhibit HIV RNA transcription in long-lived reservoir cells. Therefore, these differences in CA HIV RNA and DNA levels by treatment regimen suggest that NNRTIs are more potent in suppressing HIV residual replication than PIs, which may result in a smaller viral reservoir size. Funding: This work was supported by ZonMw (09120011910035) and FP7 Health (305522).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,352
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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