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Enregistrement W3189911886 · doi:10.1002/path.5771

<scp><i>FOXL2</i></scp> in adult‐type granulosa cell tumour of the ovary: oncogene or tumour suppressor gene?

2021· article· en· W3189911886 sur OpenAlexaff
Jessica A. Pilsworth, Anne‐Laure Todeschini, Samantha Neilson, Dawn R. Cochrane, Daniel Lai, Mikko Anttonen, Markku Heikinheimo, David G. Huntsman, Reiner A. Veitia

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Pathology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesSigrid Juséliuksen Säätiö
Mots-clésBlepharophimosisBiologyHaploinsufficiencyMutationSuppressorContext (archaeology)Somatic cellCancer researchAlleleGeneticsGeneGermline mutationPhenotypePtosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A recurrent mutation in FOXL2 (c.402C>G; p.C134W) is present in over 95% of adult-type granulosa cell tumours (AGCTs). In contrast, various loss-of-function mutations in FOXL2 lead to the development of blepharophimosis, ptosis, and epicanthus inversus syndrome (BPES). BPES is characterised by an eyelid malformation often accompanied with primary ovarian insufficiency. Two recent studies suggest that FOXL2 C402G is a gain- or change-of-function mutation with altered DNA-binding specificity. Another study proposes that FOXL2 C402G is selectively targeted for degradation, inducing somatic haploinsufficiency, suggesting its role as a tumour suppressor. The latter study relies on data indicative of an FOXL2 allelic imbalance in AGCTs. Here we present RNA-seq data as genetic evidence that no real allelic imbalance is observed at the transcriptomic level in AGCTs. Additionally, there is no loss of protein expression in tumours harbouring the mutated allele. These data and other features of this mutation compared to other oncogenes and tumour suppressor genes argue strongly against FOXL2 being a tumour suppressor in this context. Given the likelihood that FOXL2 C402G is oncogenic, targeting the variant protein or its downstream consequences is the most viable path forward to identifying an effective treatment for this cancer. © 2021 The Pathological Society of Great Britain and Ireland. Published by John Wiley & Sons, Ltd.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,332

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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