MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3189971813 · doi:10.1016/j.ejca.2021.05.040

Phase I prognostic online (PIPO): A web tool to improve patient selection for oncology early phase clinical trials

2021· article· en· W3189971813 sur OpenAlexfundno aff
Ignacio Matos, Guillermo Villacampa, Cinta Hierro, Juan Martín-Liberal, Roger Berché, Anna Pedrola, Irene Braña, Analía Azaro, María Vieito, Omar Saavedra, Itziar Gardeazábal, Alberto Hernando‐Calvo, Guzmán Alonso, Vladimir Galvao, María Ochoa de Olza, Javier Ros, Cristina Viaplana, Eva Muñoz‐Couselo, Elena Élez, Jordi Rodón, Cristina Saura, Teresa Macarulla, Ana Oaknin, Joan Carles, Enriqueta Felip, Josep Tabernero, Rodrigo Dienstmann, Elena Garralda

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Cancer · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFoundation MedicinePharmacyclicsChugai PharmaceuticalGenentechSociedad Española de Oncología MédicaPharmaMarEuropean Society for Medical OncologyAstellas PharmaEisaiCancer Research UKSeagenCilagPuma BiotechnologyArog PharmaceuticalsEisai CanadaBeiGeneClovis OncologyTeva Pharmaceutical IndustriesLes Laboratories Pierre FabreRegeneron PharmaceuticalsIpsenArray BioPharmaMersana TherapeuticsExelixisKaryopharm TherapeuticsSymphogenPfizerIncyteGrifolsF. Hoffmann-La RocheAmgenDeciphera PharmaceuticalsTakeda OncologyHalozymeSanofiGlaxoSmithKlineCelgeneDaiichi Sankyo EuropeServierBayerAstraZenecaEli Lilly and CompanySamsungBristol-Myers Squibb
Mots-clésMedicineCohortClinical endpointOncologyInternal medicineConfidence intervalClinical trialSurrogate endpoint

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Patient selection in phase 1 clinical trials (Ph1t) continues to be a challenge. The aim of this study was to develop a user-friendly prognostic calculator for predicting overall survival (OS) outcomes in patients to be included in Ph1t with immune checkpoint inhibitors (ICIs) or targeted agents (TAs) based on clinical parameters assessed at baseline. METHODS: Using a training cohort with consecutive patients from the VHIO phase 1 unit, we constructed a prognostic model to predict median OS (mOS) as a primary endpoint and 3-month (3m) OS rate as a secondary endpoint. The model was validated in an internal cohort after temporal data splitting and represented as a web application. RESULTS: We recruited 799 patients (training and validation sets, 558 and 241, respectively). Median follow-up was 21.2 months (m), mOS was 10.2 m (95% CI, 9.3-12.7) for ICIs cohort and 7.7 m (95% CI, 6.6-8.6) for TAs cohort. In the multivariable analysis, six prognostic variables were independently associated with OS - ECOG, number of metastatic sites, presence of liver metastases, derived neutrophils/(leukocytes minus neutrophils) ratio [dNLR], albumin and lactate dehydrogenase (LDH) levels. The phase 1 prognostic online (PIPO) calculator showed adequate discrimination and calibration performance for OS, with C-statistics of 0.71 (95% CI 0.64-0.78) in the validation set. The overall accuracy of the model for 3m OS prediction was 87.2% (95% CI 85%-90%). CONCLUSIONS: PIPO is a user-friendly objective and interactive tool to calculate specific survival probabilities for each patient before enrolment in a Ph1t. The tool is available at https://pipo.vhio.net/.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,018
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,061
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,096

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0180,061
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0200,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,106
Tête enseignante GPT0,476
Écart entre enseignants0,370 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueEuropean Journal of CancerMême sujetCancer Immunotherapy and BiomarkersTravaux en français237 207