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Enregistrement W3190356469 · doi:10.1101/2021.08.09.455721

A computational approach for generating smooth estimates of motor unit discharge rates and visualizing population discharge characteristics

2021· preprint· en· W3190356469 sur OpenAlexfundno aff
James A. Beauchamp, Obaid U. Khurram, Julius P. A. Dewald, C. J. Heckman, Gregory E. P. Pearcey

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueMuscle activation and electromyography studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Heart, Lung, and Blood InstituteNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaNational Institutes of Health
Mots-clésMotor unitGeneralizability theoryPopulationSupport vector machineIsometric exerciseVisualizationComputer scienceStatisticsPattern recognition (psychology)Artificial intelligenceMathematicsBiologyAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Objective Successive improvements in high density surface electromyography and decomposition techniques have facilitated an increasing yield in decomposed motor unit (MU) spike times. Though these advancements enhance the generalizability of findings and promote the application of MU discharge characteristics to inform the neural control of motor output, limitations remain. Specifically, 1) common approaches for generating smooth estimates of MU discharge rates introduce artifacts in quantification, which may bias findings, and 2) discharge characteristics of large MU populations are often difficult to visualize. Approach In the present study, we propose support vector regression (SVR) as an improved approach for generating continuous estimates of discharge rate and compare the fit characteristics of SVR to traditionally used methods, including Hanning window filtering and polynomial regression. Furthermore, we introduce ensembles as a method to visualize the discharge characteristics of large MU populations. We define ensembles as the average discharge profile of a subpopulation of MUs, composed of a time normalized ensemble average of all units within this subpopulation. Analysis was conducted with MUs decomposed from the tibialis anterior (N = 2128), medial gastrocnemius (N = 2673), and soleus (N = 1190) during isometric plantarflexion and dorsiflexion contractions. Main Result Compared to traditional approaches, we found SVR to alleviate commonly observed inaccuracies and produce significantly less absolute fit error in the initial phase of MU discharge and throughout the entire duration of discharge. Additionally, we found the visualization of MU populations as ensembles to intuitively represent population discharge characteristics with appropriate accuracy for visualization. Significance The results and methods outlined here provide an improved method for generating smooth estimates of MU discharge rate with SVR and present a unique approach to visualizing MU populations with ensembles. In combination, the use of SVR and generation of ensembles represent an efficient method for rendering population discharge characteristics.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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