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Enregistrement W3190857325 · doi:10.1101/2021.08.02.454546

Structural Basis and Mode of Action for Two Broadly Neutralizing Antibodies Against SARS-CoV-2 Emerging Variants of Concern

2021· preprint· en· W3190857325 sur OpenAlexafffund
Wenwei Li, Yaozong Chen, Jérémie Prévost, Irfan Ullah, Maolin Lu, Shang Yu Gong, Alexandra Tauzin, Romain Gasser, Dani Vézina, Sai Priya Anand, Guillaume Goyette, Debashree Chaterjee, Shilei Ding, William D. Tolbert, Michael W. Grunst, Yuxia Bo, Shijian Zhang, Jonathan Richard, Fei Zhou, Rick Huang, Lothar Esser, Allison Zeher, Marceline Côté, Priti Kumar, Joseph Sodroski, Di Xia, Pradeep D. Uchil, Marzena Pazgier, Andrés Finzi, Walther Mothes

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 and COVID-19 Research
Établissements canadiensUniversity of OttawaUniversité de MontréalMcGill UniversityCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesSLAC National Accelerator LaboratoryBasic Energy SciencesNational Institute of General Medical SciencesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health ResearchOffice of ScienceNational Institutes of HealthCanada Research ChairsGenome CanadaMinistère de la SantéMinistère de la Santé et des Services sociauxUniversity of OxfordBiological and Environmental ResearchFondation du CHUMU.S. Department of EnergyGénome QuébecYale University
Mots-clésImmunogenEpitopeBiologyVirologyAntibodyMonoclonal antibodyNeutralizing antibodyImmune systemCoronavirusProtein subunitViral entryCoronavirus disease 2019 (COVID-19)ImmunologyGeneticsVirusMedicineGeneViral replication

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Emerging variants of concern for the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) can transmit more efficiently and partially evade protective immune responses, thus necessitating continued refinement of antibody therapies and immunogen design. Here we elucidate the structural basis and mode of action for two potent SARS-CoV-2 Spike (S) neutralizing monoclonal antibodies CV3-1 and CV3-25 that remained effective against emerging variants of concern in vitro and in vivo. CV3-1 bound to the (485-GFN-487) loop within the receptor-binding domain (RBD) in the "RBD-up" position and triggered potent shedding of the S1 subunit. In contrast, CV3-25 inhibited membrane fusion by binding to an epitope in the stem helix region of the S2 subunit that is highly conserved among β-coronaviruses. Thus, vaccine immunogen designs that incorporate the conserved regions in RBD and stem helix region are candidates to elicit pan-coronavirus protective immune responses.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,354
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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