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Enregistrement W3190987911 · doi:10.1096/fj.202100276rr

Transcriptomic links to muscle mass loss and declines in cumulative muscle protein synthesis during short‐term disuse in healthy younger humans

2021· article· en· W3190987911 sur OpenAlexafffund
Craig R. G. Willis, Iain J. Gallagher, Daniel J. Wilkinson, Matthew S. Brook, Joseph J. Bass, Bethan E. Phillips, Kenneth Smith, Timothy Etheridge, Tanner Stokes, Chris McGlory, Stefan H. M. Gorissen, Nathaniel J. Szewczyk, Stuart M. Phillips, Philip J. Atherton

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMuscle Physiology and Disorders
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesNIHR Nottingham Biomedical Research CentreNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMedical Research CouncilDirectorate for Biological SciencesVersus ArthritisResearch Councils UKNational Institute for Health and Care ResearchBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDepartment of Health and Social CareGovernment of Canada
Mots-clésTranscriptomeMuscle atrophyBiologySkeletal muscleAnabolismSarcopeniaMuscle massEndocrinologyCell biologyInternal medicineNeuroscienceBioinformaticsGene expressionGeneMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Muscle disuse leads to a rapid decline in muscle mass, with reduced muscle protein synthesis (MPS) considered the primary physiological mechanism. Here, we employed a systems biology approach to uncover molecular networks and key molecular candidates that quantitatively link to the degree of muscle atrophy and/or extent of decline in MPS during short‐term disuse in humans. After consuming a bolus dose of deuterium oxide (D 2 O; 3 mL.kg −1 ), eight healthy males (22 ± 2 years) underwent 4 days of unilateral lower‐limb immobilization. Bilateral muscle biopsies were obtained post‐intervention for RNA sequencing and D 2 O‐derived measurement of MPS, with thigh lean mass quantified using dual‐energy X‐ray absorptiometry. Application of weighted gene co‐expression network analysis identified 15 distinct gene clusters (“modules”) with an expression profile regulated by disuse and/or quantitatively connected to disuse‐induced muscle mass or MPS changes. Module scans for candidate targets established an experimentally tractable set of candidate regulatory molecules (242 hub genes, 31 transcriptional regulators) associated with disuse‐induced maladaptation, many themselves potently tied to disuse‐induced reductions in muscle mass and/or MPS and, therefore, strong physiologically relevant candidates. Notably, we implicate a putative role for muscle protein breakdown‐related molecular networks in impairing MPS during short‐term disuse, and further establish DEPTOR (a potent mTOR inhibitor) as a critical mechanistic candidate of disuse driven MPS suppression in humans. Overall, these findings offer a strong benchmark for accelerating mechanistic understanding of short‐term muscle disuse atrophy that may help expedite development of therapeutic interventions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,696
Score d'incertitude au seuil0,497

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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