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Enregistrement W3191034830 · doi:10.3390/nu13082657

Anti-Salmonella Activity and Peptidomic Profiling of Peptide Fractions Produced from Sturgeon Fish Skin Collagen (Huso huso) Using Commercial Enzymes

2021· article· en· W3191034830 sur OpenAlexafffund
Maryam Atef, Yasmina Ait Chait, Seýed Mahdi Ojagh, Ali Mohammad Latifi, Mina Esmaeili, Riadh Hammami, Chibuike C. Udenigwe

Notice bibliographique

RevueNutrients · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Hydrolysis and Bioactive Peptides
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPapainHydrolysateTrypsinChemistryPeptidePepsinBiochemistryAntibacterial activityHydrolysisChromatographyEnzymeBiologyBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study investigated peptide fractions from fish skin collagen for antibacterial activity against Escherichia coli and Salmonella strains. The collagen was hydrolyzed with six commercial proteases, including trypsin, Alcalase, Neutrase, Flavourzyme, pepsin and papain. Hydrolyzed samples obtained with trypsin and Alcalase had the largest number of small peptides (molecular weight <10 kDa), while the hydrolysate produced with papain showed the lowest degree of hydrolysis and highest number of large peptides. Four hydrolysates were found to inhibit the growth of the Gram-negative bacteria, with papain hydrolysate showing the best activity against E. coli, and Neutrase and papain hydrolysates showing the best activity against S. abony; hydrolysates produced with trypsin and pepsin did not show detectable antibacterial activity. After acetone fractionation of the latter hydrolysates, the peptide fractions demonstrated enhanced dose-dependent inhibition of the growth (colony-forming units) of four Salmonella strains, including S. abony (NCTC 6017), S. typhimurium (ATCC 13311), S. typhimurium (ATCC 14028) and S. chol (ATCC 10708). Shotgun peptidomics analysis of the acetone fractions of Neutrase and papain hydrolysates resulted in the identification of 71 and 103 peptides, respectively, with chain lengths of 6–22 and 6–24, respectively. This work provided an array of peptide sequences from fish skin collagen for pharmacophore identification, structure–activity relationship studies, and further investigation as food-based antibacterial agents against pathogenic microorganisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,891

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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