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Enregistrement W3191078942 · doi:10.1016/j.jbc.2021.101073

The aminoglycoside G418 hinders de novo prion infection in cultured cells

2021· article· en· W3191078942 sur OpenAlexafffund
Hamza Arshad, Zeel Patel, Mohadeseh Mehrabian, Matthew E.C. Bourkas, Zaid A.M. Al‐Azzawi, Gerold Schmitt‐Ulms, Joel C. Watts

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensOccupational Cancer Research CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyHamsterTransfectionIn vitroVirologyCell cultureProteasePrion proteinAminoglycosideEndogenyMolecular biologyMicrobiologyAntibioticsEnzymeGeneticsBiochemistryDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The study of prions and the discovery of candidate therapeutics for prion disease have been facilitated by the ability of prions to replicate in cultured cells. Paradigms in which prion proteins from different species are expressed in cells with low or no expression of endogenous prion protein (PrP) have expanded the range of prion strains that can be propagated. In these systems, cells stably expressing a PrP of interest are typically generated via coexpression of a selectable marker and treatment with an antibiotic. Here, we report the unexpected discovery that the aminoglycoside G418 (Geneticin) interferes with the ability of stably transfected cultured cells to become infected with prions. In G418-resistant lines of N2a or CAD5 cells, the presence of G418 reduced levels of protease-resistant PrP following challenge with the RML or 22L strains of mouse prions. G418 also interfered with the infection of cells expressing hamster PrP with the 263K strain of hamster prions. Interestingly, G418 had minimal to no effect on protease-resistant PrP levels in cells with established prion infection, arguing that G418 selectively interferes with de novo prion infection. As G418 treatment had no discernible effect on cellular PrP levels or its localization, this suggests that G418 may specifically target prion assemblies or processes involved in the earliest stages of prion infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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