MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3191139421 · doi:10.1093/brain/awab299

<i>De novo DHDDS</i> variants cause a neurodevelopmental and neurodegenerative disorder with myoclonus

2021· article· en· W3191139421 sur OpenAlexafffund
Serena Galosi, Ban H. Edani, Simone Martinelli, Hana Hansíková, Erik A. Eklund, Caterina Caputi, Laura Masuelli, Nicole Corsten‐Janssen, Myriam Srour, Renske Oegema, Daniëlle G.M. Bosch, Colin A. Ellis, Louise Amlie‐Wolf, Andrea Accogli, Isis Atallah, Luisa Averdunk, Kristin Barañano, Roberto Bei, Irene Bagnasco, Alfredo Brusco, Scott Demarest, Anne-Sophie Alaix, Carlo Di Bonaventura, Felix Dıstelmaıer, Frances Elmslie, Ziv Gan‐Or, Jean-Marc Good, Karen W. Gripp, Erik‐Jan Kamsteeg, Ellen F. Macnamara, Carlo Marcelis, N. Mercier, Joseph Peeden, Simone Pizzi, Luca Pannone, Marwan Shinawi, Camilo Toro, Nienke E. Verbeek, Sunita Venkateswaran, Patricia G. Wheeler, Lucie Zdražilová, Rong Zhang, Giovanna Zorzi, Renzo Guerrini, William C. Sessa, Dirk J. Lefeber, Fadi F. Hamdan, Kariona A. Grabińska, Vincenzo Leuzzi

Notice bibliographique

RevueBrain · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-JustineMontreal Neurological Institute and HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioMcGill University
Organismes subventionnairesCommon FundEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human DevelopmentNational Institute of Neurological Disorders and StrokeZonMwNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesMinistero della SaluteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of HealthParkinson CanadaMinistero dell’Istruzione, dell’Università e della RicercaE-RareAgence Nationale de la RechercheDipartimenti di Eccellenza
Mots-clésDolicholRetinitis pigmentosaNeurodevelopmental disorderAtaxiaBiologyDystoniaMyoclonusInternal medicineGeneticsNeuroscienceMedicineBiochemistryEnzymeBiosynthesisRetina

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Subcellular membrane systems are highly enriched in dolichol, whose role in organelle homeostasis and endosomal-lysosomal pathway remains largely unclear besides being involved in protein glycosylation. DHDDS encodes for the catalytic subunit (DHDDS) of the enzyme cis-prenyltransferase (cis-PTase), involved in dolichol biosynthesis and dolichol-dependent protein glycosylation in the endoplasmic reticulum. An autosomal recessive form of retinitis pigmentosa (retinitis pigmentosa 59) has been associated with a recurrent DHDDS variant. Moreover, two recurring de novo substitutions were detected in a few cases presenting with neurodevelopmental disorder, epilepsy and movement disorder. We evaluated a large cohort of patients (n = 25) with de novo pathogenic variants in DHDDS and provided the first systematic description of the clinical features and long-term outcome of this new neurodevelopmental and neurodegenerative disorder. The functional impact of the identified variants was explored by yeast complementation system and enzymatic assay. Patients presented during infancy or childhood with a variable association of neurodevelopmental disorder, generalized epilepsy, action myoclonus/cortical tremor and ataxia. Later in the disease course, they experienced a slow neurological decline with the emergence of hyperkinetic and/or hypokinetic movement disorder, cognitive deterioration and psychiatric disturbances. Storage of lipidic material and altered lysosomes were detected in myelinated fibres and fibroblasts, suggesting a dysfunction of the lysosomal enzymatic scavenger machinery. Serum glycoprotein hypoglycosylation was not detected and, in contrast to retinitis pigmentosa and other congenital disorders of glycosylation involving dolichol metabolism, the urinary dolichol D18/D19 ratio was normal. Mapping the disease-causing variants into the protein structure revealed that most of them clustered around the active site of the DHDDS subunit. Functional studies using yeast complementation assay and in vitro activity measurements confirmed that these changes affected the catalytic activity of the cis-PTase and showed growth defect in yeast complementation system as compared with the wild-type enzyme and retinitis pigmentosa-associated protein. In conclusion, we characterized a distinctive neurodegenerative disorder due to de novo DHDDS variants, which clinically belongs to the spectrum of genetic progressive encephalopathies with myoclonus. Clinical and biochemical data from this cohort depicted a condition at the intersection of congenital disorders of glycosylation and inherited storage diseases with several features akin to of progressive myoclonus epilepsy such as neuronal ceroid lipofuscinosis and other lysosomal disorders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,520
Score d'incertitude au seuil0,416

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,203
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBrainMême sujetCellular transport and secretionTravaux en français237 207