Antibody response to SARS-CoV-2 among individuals with IBD diminishes over time: a serosurveillance cohort study
Notice bibliographique
Résumé
We read with interest the highly impactful CLARITY IBD study that demonstrated a diminished serological response to SARS-CoV-2 in individuals with IBD receiving infliximab as compared with those receiving vedolizumab.1 We assessed the prevalence of antibodies to SARS-CoV-2 in patients with IBD and evaluated whether serological response to SARS-CoV-2 wanes over time following infection. Individuals with IBD from Calgary, Canada, were recruited from October 2020 to April 2021 and stratified into two cohorts: (1) serosurveillance (n=279) defined as those who were not previously diagnosed with COVID-19; and (2) COVID-19 recovered (n=45), defined as those with a molecular-confirmed diagnosis of SARS-CoV-2 infection via PCR. Serum was analysed using the Abbott Architect SARS-CoV-2 IgG antibody to the nucleocapsid protein. A positive antibody test was defined as an index signal/cut-off ≥1.4. The assay has been validated with 95% sensitivity and >99% specificity 12 days following symptom onset and correlates to neutralising antibodies.2 We assessed the proportion, with 95% CIs, of individuals with IBD who mounted an antibody response among those undergoing serosurveillance and following infection with SARS-CoV-2. In those diagnosed with COVID-19, we calculated the days from diagnosis to serological testing and developed a logistic regression model that assessed the effect of time from COVID-19 diagnosis to serology testing (before vs after 90 days) on nucleocapsid positive versus negative antibody; adjusted for age, sex and anti-tumour necrosis factor (TNF) usage. The baseline characteristics of the two cohorts are summarised in table 1. Among the serosurveillance cohort, 1.08% (95% CI 0.22 to …
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».