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Enregistrement W3191799262 · doi:10.3389/fmars.2021.705042

Seasonal Variability in the Zooplankton Community Structure in a Sub-Arctic Fjord as Revealed by Morphological and Molecular Approaches

2021· article· en· W3191799262 sur OpenAlexfundno aff
Estelle Coguiec, E. A. Ershova, Malin Daase, Tobias R. Vonnahme, Owen S. Wangensteen, Rolf Gradinger, Kim Præbel, Jørgen Berge

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Marine Science · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEnvironmental DNA in Biodiversity Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesShirshov Institute of Oceanology, Russian Academy of SciencesNatural Environment Research CouncilNorges ForskningsrådBundesministerium für Bildung und ForschungUniversité LavalUK Research and InnovationSight Research UKUniversitetet i Tromsø
Mots-clésZooplanktonAcartiaCalanusCopepodBiologySpring bloomFjordArcticAbundance (ecology)Biomass (ecology)EcologyOceanographyPhytoplanktonCrustaceanNutrient

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phyto- and zooplankton in Arctic and sub-Arctic seas show very strong seasonal changes in diversity and biomass. Here we document the seasonal variability in the mesozooplankton community structure in a sub-Arctic fjord in Northern Norway based on monthly sampling between November 2018 and February 2020. We combined traditional morphological zooplankton identification with DNA metabarcoding of a 313 base pair fragment of the COI gene. This approach allowed us to provide the most detailed mesozooplankton species list known for this region across an entire year, including both holo- and meroplankton. The zooplankton community was dominated by small copepods throughout the sampling period both in terms of abundance and relative sequence counts. However, meroplankton was the most diverse group, especially within the phylum polychaeta. We identified four distinct periods based on the seasonal analysis of the zooplankton community composition. The pre-spring bloom period (February–March) was characterized by low abundance and biomass of zooplankton. The spring bloom (April) was characterized by the presence of Calanus young stages, cirripedia and krill eggs. The spring-summer period (May–August) was characterized by a succession of meroplankton and a relatively high abundance of copepods of the genus Calanus spp. Finally, the autumn-winter period (September–December) was characterized by a high copepod diversity and a peak in abundance of small copepods (e.g., Oithona similis , Acartia longiremis , Pseudocalanus acuspes , Pseudocalanus elongatus , Pseudocalanus moultoni , Pseudocalanus minutus ). During this period, we also observed an influx of boreal warm-water species which were notably absent during the rest of the year. Both the traditional community analysis and metabarcoding were highly complementary and with a few exceptions showed similar trends in the seasonal changes of the zooplankton community structure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,882

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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