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Enregistrement W3192293529 · doi:10.1128/mbio.00490-21

Microbial Diversity and Function in Shallow Subsurface Sediment and Oceanic Lithosphere of the Atlantis Massif

2021· article· en· W3192293529 sur OpenAlexaff
Jacqueline Goordial, Timothy D’Angelo, Jessica Labonté, Nicole Poulton, Julia M. Brown, Ramūnas Stepanauskas, Gretchen L. Früh‐Green, Beth N. Orcutt

Notice bibliographique

RevuemBio · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMethane Hydrates and Related Phenomena
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungAlfred P. Sloan FoundationCenter for Dark Energy Biosphere InvestigationsUnited States Science Support ProgramJoint Genome InstituteNational Science Foundation
Mots-clésGeologyMassifSedimentLithosphereEarth scienceDiversity (politics)Function (biology)OceanographyGeochemistryGeomorphologyPaleontologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The subsurface rock beneath the ocean is one of the largest biospheres on Earth, and microorganisms within influence global-scale nutrient cycles. This biosphere is difficult to study, in part due to the low concentrations of microorganisms that inhabit the vast volume of the marine lithosphere. In spite of the global significance of this biosphere, little is currently known about the microbial ecology of such rock-associated microorganisms. This study describes the identity and genomic potential of microorganisms in the subsurface rock and sediment at the Atlantis Massif, an underwater mountain near the Mid-Atlantic Ridge. To enable our analyses, fluorescence-activated cell sorting (FACS) was used as a means to concentrate cells from low biomass environmental samples for genomic analyses. We found distinct rock-associated microorganisms and found that the capacity for microorganisms to utilize organic carbon was the most prevalent form of carbon cycling. We additionally identified a potential role for carbon monoxide metabolism in the subsurface.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,026
Score d'incertitude au seuil0,647

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,171
Écart entre enseignants0,164 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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