New genetically distinct phytoplasmas and insect carriers associated with pine tree disease revealed by a survey in the Curonian Spit, Lithuania
Notice bibliographique
Résumé
Our previous studies reported that phytoplasma was the causative agent of the pine disease in the Curonian Spit, Lithuania. In this study, insects from diseased pine trees and their adjacent areas were collected from 2016 to 2019 to further identify potential insect vectors that spread phytoplasmas. A total of 1018 phloem-feeding insects (order Hemiptera) were identified, 98.62% of which were aphids (Aphididae), and no known phytoplasma vectors were found. The results from semi-nested polymerase chain reaction (PCR) using phytoplasma-specific universal primers revealed that phytoplasmas were detected in Scots pine aphids (Cinara pini (Linnaeus, 1758)), waxy grey pine needle aphids (Cinara pineti (Fabricius, 1781)), and species-unknown aphids. Further sequence analysis and virtual RFLP (restriction fragment length polymorphism) analysis of aphid-harbored phytoplasma strains indicated that they were closely related to ‘Candidatus Phytoplasma pini’ (16SrXXI-A), but mainly 16SrXXI-A variants, which were also main strains identified in diseased pine trees. In addition, three new phytoplasma subgroups were delineated in the present study. Subgroups 16SrXXI-C and 16SrXXI-D were unveiled from previously identified (but classification was overlooked) Lithuanian pine phytoplasma strains. Subgroup 16SrXXI-E was discovered from the newly identified aphid-harbored phytoplasmas. Further transmission trial studies on these aphids will provide insights into the epidemiology and pathosystem of pine phytoplasma diseases, as well as disease management.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».