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Enregistrement W3192522080 · doi:10.1186/s12913-021-06762-0

Validity of an algorithm to identify cardiovascular deaths from administrative health records: a multi-database population-based cohort study

2021· article· en· W3192522080 sur OpenAlexafffundabout
Lisa M. Lix, Shamsia Sobhan, Audray St-Jean, Jean-Marc Daigle, Anat Fisher, Oriana Hoi Yun Yu, Sophie Dell’Aniello, Nianping Hu, Shawn Bugden, Baiju R. Shah, Paul E. Ronksley, Silvia Alessi‐Severini, Antonios Douros, Pierre Ernst, Kristian B. Filion

Notice bibliographique

RevueBMC Health Services Research · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiabetes Treatment and Management
Établissements canadiensManitoba HealthUniversity of CalgaryHealth Sciences CentreUniversity of TorontoMemorial University of NewfoundlandJewish General HospitalSunnybrook Health Science CentreSaskatchewan Health Quality CouncilInstitute for Clinical Evaluative SciencesMcGill UniversityUniversity of British ColumbiaInstitut National d'Excellence en Santé et en Services SociauxUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchFonds de Recherche du Québec - SantéMinistry of Health, British ColumbiaOntario Ministry of Health and Long-Term CareMcGill University
Mots-clésMedicineCohortConfidence intervalPopulationRecord linkagePsychological interventionMedical prescriptionDatabaseCause of deathCohort studyNational Death IndexDemographyAlgorithmInternal medicineEnvironmental healthHazard ratioDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Cardiovascular death is a common outcome in population-based studies about new healthcare interventions or treatments, such as new prescription medications. Vital statistics registration systems are often the preferred source of information about cause-specific mortality because they capture verified information about the deceased, but they may not always be accessible for linkage with other sources of population-based data. We assessed the validity of an algorithm applied to administrative health records for identifying cardiovascular deaths in population-based data. METHODS: Administrative health records were from an existing multi-database cohort study about sodium-glucose cotransporter-2 (SGLT2) inhibitors, a new class of antidiabetic medications. Data were from 2013 to 2018 for five Canadian provinces (Alberta, British Columbia, Manitoba, Ontario, Quebec) and the United Kingdom (UK) Clinical Practice Research Datalink (CPRD). The cardiovascular mortality algorithm was based on in-hospital cardiovascular deaths identified from diagnosis codes and select out-of-hospital deaths. Sensitivity, specificity, and positive and negative predictive values (PPV, NPV) were calculated for the cardiovascular mortality algorithm using vital statistics registrations as the reference standard. Overall and stratified estimates and 95% confidence intervals (CIs) were computed; the latter were produced by site, location of death, sex, and age. RESULTS: The cohort included 20,607 individuals (58.3% male; 77.2% ≥70 years). When compared to vital statistics registrations, the cardiovascular mortality algorithm had overall sensitivity of 64.8% (95% CI 63.6, 66.0); site-specific estimates ranged from 54.8 to 87.3%. Overall specificity was 74.9% (95% CI 74.1, 75.6) and overall PPV was 54.5% (95% CI 53.7, 55.3), while site-specific PPV ranged from 33.9 to 72.8%. The cardiovascular mortality algorithm had sensitivity of 57.1% (95% CI 55.4, 58.8) for in-hospital deaths and 72.3% (95% CI 70.8, 73.9) for out-of-hospital deaths; specificity was 88.8% (95% CI 88.1, 89.5) for in-hospital deaths and 58.5% (95% CI 57.3, 59.7) for out-of-hospital deaths. CONCLUSIONS: A cardiovascular mortality algorithm applied to administrative health records had moderate validity when compared to vital statistics data. Substantial variation existed across study sites representing different geographic locations and two healthcare systems. These variations may reflect different diagnostic coding practices and healthcare utilization patterns.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,201
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,416
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,201
Score d'incertitude au seuil0,985

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2010,416
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,003
Bibliométrie0,0040,004
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0060,003
Science ouverte0,0040,004
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,155
Tête enseignante GPT0,489
Écart entre enseignants0,334 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2021
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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