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Enregistrement W3192555423 · doi:10.1101/2021.04.12.439270

Reduced <i>Shmt2</i> expression impairs mitochondrial folate accumulation and respiration, and leads to uracil accumulation in mouse mitochondrial DNA

2021· preprint· en· W3192555423 sur OpenAlexaff
Joanna Fiddler, Yuwen Xiu, Jamie Blum, Simon G. Lamarre, Whitney N. Phinney, Sally P. Stabler, Margaret E. Brosnan, John T. Brosnan, Anna Thalacker‐Mercer, Martha S. Field

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensMemorial University of NewfoundlandUniversité de Moncton
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMitochondrial DNAUracilBiologyMitochondrionSerine hydroxymethyltransferaseMolecular biologyBiochemistryCell biologyDNASerineGenePhosphorylation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Background Adequate cellular thymidylate (dTMP) pools are essential for preservation of nuclear and mitochondrial genome stability. Previous studies have indicated that disruption in dTMP synthesis in the nucleus leads to increased uracil misincorporation into DNA affecting genome stability. To date, the effects of impaired mitochondrial dTMP synthesis in non- transformed tissues have been understudied. Objective This study aimed to determine the effects of decreased serine hydroxymethyltransferase 2 ( Shmt2) expression and dietary folate deficiency on mitochondrial DNA integrity and mitochondrial function in mouse tissues. Methods Liver mitochondrial DNA (mtDNA) content, and uracil content in liver mtDNA was measured in Shmt2 +/- and Shmt2 +/+ mice weaned onto either a folate-sufficient control diet (2 mg/kg folic acid, C) or a modified diet lacking folic acid (0 mg/kg folic acid, FD) for 7 wks. Shmt2 +/- and Shmt2 +/+ mouse embryonic fibroblasts (MEF cells) were cultured in defined culture medium containing either 0 or 25 nM folate to assess proliferative capacity and mitochondrial function. Results Shmt2 +/- mice exhibited 48-67% reduction in SHMT2 protein levels in tissues. Interestingly, Shmt2 +/- mice consuming the folate-sufficient C diet exhibited a 25% reduction in total folate in liver mitochondria. There was also a >20-fold increase in uracil in liver mtDNA in Shmt2 +/- mice consuming the C diet, and dietary folate deficiency also increased uracil content in mouse liver mtDNA from both Shmt2 +/+ and Shmt2 +/- mice. Furthermore, decreased Shmt2 expression in MEF cells reduced cell proliferation, mitochondrial membrane potential, and oxygen consumption rate. Conclusions This study demonstrates that Shmt2 heterozygosity and dietary folate deficiency impair mitochondrial dTMP synthesis, as evidenced by the increased uracil in mtDNA. In addition, Shmt2 heterozygosity impairs mitochondrial function in MEF cells. These findings suggest that elevated uracil in mtDNA may impair mitochondrial function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,306
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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