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Enregistrement W3192709142 · doi:10.1002/adfm.202105349

An Engineered Patient‐Derived Tumor Organoid Model That Can Be Disassembled to Study Cellular Responses in a Graded 3D Microenvironment

2021· article· en· W3192709142 sur OpenAlexafffund
Natalie Landon‐Brace, Jose L. Cadavid, Simon Latour, Ileana L. Co, Darren Rodenhizer, Nancy T. Li, Nila C. Wu, Eryn Bugbee, Aleks Chebotarev, Ji Zhang, Bradly G. Wouters, Alison P. McGuigan

Notice bibliographique

RevueAdvanced Functional Materials · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Cells and Metastasis
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada First Research Excellence FundOntario Centres of Excellence
Mots-clésOrganoidTumor microenvironmentCell biologyJurkat cellsCell cultureCellSpheroidMaterials scienceBiologyCancer researchTumor cellsImmunologyImmune systemT cellGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Patient‐derived organoids (PDOs) are emerging as powerful models to capture the genetic heterogeneity of human tumors. However, the self‐assembling nature of PDOs limits their use in studies of the impact of microenvironmental heterogeneity on tumor cell function. Here, a paper‐based model, the Tissue Roll for Analysis of Cellular Environment and Response (TRACER) is adapted, using patterned polymer infiltration, to enable controlled assembly and disassembly of organoid structures to study the impact of both genetic and microenvironmental heterogeneity on tumor cell behavior. In the adapted platform (TRACER2), pancreatic cancer PDOs establish oxygen gradients across the tissue and in response exhibit graded cell viability, proliferation, hypoxia‐response gene transcription, and response to gemcitabine therapy. Further, PDOs retrieved from the hypoxic regions of the TRACER2 cultures show graded transcriptional changes in immunosuppression‐related genes and upon co‐culture, after TRACER2 disassembly, induce graded functional changes in Jurkat cells and macrophage cells. Therefore, TRACER2 offers a novel platform to dissect the effects of microenvironmental parameters on tumor cell function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,230 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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