Development of a Simple Morphometric Model to Identify Sex in Chinook Salmon Returning to Spawn in the Yukon River
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Chinook Salmon Oncorhynchus tshawytscha support major fisheries in the Yukon River in Canada and the United States. Demographic data, including length, age, and sex composition of annual runs underpin management programs tasked with meeting escapement goals and providing for various fisheries within the drainage. Numerous sampling projects along the river collect these data annually, most without sacrificing fish. However, substantial error can occur when assigning sex based on observations of secondary sexual characteristics, particularly early in the spawning migration. We sought to develop a quantitative method of analyzing morphology of Chinook Salmon in the Yukon River that would achieve ≥95% accuracy of sex assignment with live fish. We collected snout lengths (SL) and mid-eye-to-fork lengths (MEF) from 2,342 known-sex fish from six regions of the drainage ranging from 40 to 2,000 km upstream from the sea, including a collection from postspawning fish. We fit three logistic regression models to the data using MEF, the ratio of SL to MEF, and regional group as covariates, including interactions and quadratic terms. Model selection was made using Akaike information criterion and cross-validation of prediction performance. Accuracy rates of the final quantitative model ranged from 79% for a lower Yukon River group to 92% for the postspawning group. Though short of our accuracy goal, the quantitative method may provide an improvement over existing methods of sex assignments in some regions of the drainage. Lower assignment rates in the lower river may reflect the mixed-stock composition of the fishery, where samples include fish with both short and long migrations ahead of them. However, we speculate that Chinook Salmon migrating to upper Yukon River spawning areas minimize the expression of secondary sexual characteristics, such as SL in males, and instead allocate their energy reserves to accomplishing the long migrations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».