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Enregistrement W3193445523 · doi:10.1007/s00705-021-05205-9

Bacterial Viruses Subcommittee and Archaeal Viruses Subcommittee of the ICTV: update of taxonomy changes in 2021

2021· article· en· W3193445523 sur OpenAlexaff
Mart Krupovìč, Dann Turner, Vera V. Morozova, Mike Dyall‐Smith, Hanna M. Oksanen, Robert A. Edwards, Bas E. Dutilh, Susan M. Lehman, Alejandro Reyes, Diana P. Baquero, Matthew B. Sullivan, Jumpei Uchiyama, Jesca Nakavuma, Jakub Barylski, Mark Young, Shishen Du, Poliane Alfenas‐Zerbini, Kushkina Ai, Andrew M. Kropinski, D. İpek Kurtböke, J. Rodney Brister, Cédric Lood, B L Sarkar, Yigang Tong, Ying Liu, Li Huang, Johannes Wittmann, Ніна Чанішвілі, Leonardo Joaquim van Zyl, J. Rumnieks, Tomohiro Mochizuki, Matti Jalasvuori, Ramy K. Aziz, Małgorzata Łobocka, Kenneth M. Stedman, Andrey N. Shkoporov, Annika Gillis, Xu Peng, François Enault, Petar Knežević, Rob Lavigne, Sung‐Keun Rhee, Virginija Cvirkaitė‐Krupovič, Cristina Moraru, Andrea I. Moreno‐Switt, Minna M. Poranen, Andrew Millard, David Prangishvili, Evelien M. Adriaenssens

Notice bibliographique

RevueArchives of Virology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesDivision of Biological InfrastructureWellcome TrustBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Education and Science of the Russian FederationDirectorate for Biological SciencesNational Institutes of HealthNovo NordiskJane ja Aatos Erkon SäätiöFonds Wetenschappelijk OnderzoekChinese Academy of SciencesNovo Nordisk FondenAcademy of FinlandJapan Science and Technology AgencyNational Natural Science Foundation of ChinaSumitomo FoundationDeutsche ForschungsgemeinschaftNational Research FoundationHelsingin YliopistoEuropean CommissionNational Research Foundation of KoreaEuropean Research CouncilGordon and Betty Moore FoundationDanmarks Frie ForskningsfondNational Science FoundationNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesWellcomeAcademy of Scientific Research and Technology
Mots-clésBiologyVirologyVirus classificationTaxonomy (biology)Medical microbiologyGeneticsZoologyGenomeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this article, we - the Bacterial Viruses Subcommittee and the Archaeal Viruses Subcommittee of the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) - summarise the results of our activities for the period March 2020 - March 2021. We report the division of the former Bacterial and Archaeal Viruses Subcommittee in two separate Subcommittees, welcome new members, a new Subcommittee Chair and Vice Chair, and give an overview of the new taxa that were proposed in 2020, approved by the Executive Committee and ratified by vote in 2021. In particular, a new realm, three orders, 15 families, 31 subfamilies, 734 genera and 1845 species were newly created or redefined (moved/promoted).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,555
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations41
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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