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Enregistrement W3193626724 · doi:10.5376/rgg.2021.12.0004

Identification of Loss of Gene Function Phenomenon in Restorer Line and Its Mutant of Dian Type Hybrid Rice

2021· article· en· W3193626724 sur OpenAlexvenueno aff
Feng Tian, Qian Zhu, Xiaoqiong Guo, Wei Li, Weilin Yu, Shichuan Li, Wenbin Wu, Ziwei Wan, Huang Dajun, Lijuan Chen, Dongsun Lee

Notice bibliographique

RevueRice Genomics and Genetics · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutantBiologyPopulationWild typeMutation breedingGrain qualityGeneticsGeneHorticultureMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In this study, we carried out a classification survey on sterile plants in the F 1 population of high-quality and high-yield Dian-type japonica hybrid rice ‘Dianheyou 34’, combining with the basic agronomic traits and biological information of the backbone restorer line ‘Nan34’ and its mutant Rf1 restorer gene lost mutant, the phenomenon and cause of function loss of restorer lines were preliminarily explored. The results showed that the loss of function with natural mutation at Rf1 in ‘Nan34’ was the main factor that led to sterile plants (two years accounted for 0.26% and 0.79% respectively) in ‘Dianheyou 34’F 1 hybrid population; the seed setting rate of ‘Nan34’ wild type was no significant difference compared with its mutant, and the wild type was slightly higher than the mutant in pollen fertility, plant height, ear length and grain length, and slightly greater than the wild type in grain width. By cloning the Rf1 locus of ‘Nan34’ wild type and its mutant, we found that the mutant in ORF region lost a 574 bp long sequence compared with the wild type, which made it unable to encode some PPR proteins. The loss of this sequence may lead to the loss of recovery function. The results lay a theoretical foundation for revealing genetic variation mechanism of restorer genes in three-line hybrid rice breeding and utilization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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