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Enregistrement W3193688561 · doi:10.1371/journal.pone.0255977

A machine learning approach to predict extreme inactivity in COPD patients using non-activity-related clinical data

2021· article· en· W3193688561 sur OpenAlexaff
B. Aguilaniu, David J. Hess, É. Kelkel, Amandine Briault, Marie Destors, Jacques Boutros, Pei Zhi Li, Anestis Antoniadis

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesChiesi EspañaChiesi FarmaceuticiNovartisGlaxoSmithKlineAstraZeneca
Mots-clésCOPDMedicinePulmonologistsPulmonologistReceiver operating characteristicConfidence intervalAlgorithmInternal medicineMachine learningPhysical therapyComputer scienceIntensive care medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Facilitating the identification of extreme inactivity (EI) has the potential to improve morbidity and mortality in COPD patients. Apart from patients with obvious EI, the identification of a such behavior during a real-life consultation is unreliable. We therefore describe a machine learning algorithm to screen for EI, as actimetry measurements are difficult to implement. Complete datasets for 1409 COPD patients were obtained from COLIBRI-COPD, a database of clinicopathological data submitted by French pulmonologists. Patient- and pulmonologist-reported estimates of PA quantity (daily walking time) and intensity (domestic, recreational, or fitness-directed) were first used to assign patients to one of four PA groups (extremely inactive [EI], overtly active [OA], intermediate [INT], inconclusive [INC]). The algorithm was developed by (i) using data from 80% of patients in the EI and OA groups to identify 'phenotype signatures' of non-PA-related clinical variables most closely associated with EI or OA; (ii) testing its predictive validity using data from the remaining 20% of EI and OA patients; and (iii) applying the algorithm to identify EI patients in the INT and INC groups. The algorithm's overall error for predicting EI status among EI and OA patients was 13.7%, with an area under the receiver operating characteristic curve of 0.84 (95% confidence intervals: 0.75-0.92). Of the 577 patients in the INT/INC groups, 306 (53%) were reclassified as EI by the algorithm. Patient- and physician- reported estimation may underestimate EI in a large proportion of COPD patients. This algorithm may assist physicians in identifying patients in urgent need of interventions to promote PA.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,012
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,023

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,012
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,187
Tête enseignante GPT0,350
Écart entre enseignants0,163 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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