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Enregistrement W3193694995 · doi:10.1016/j.tox.2021.152900

Reproducibility of adipogenic responses to metabolism disrupting chemicals in the 3T3-L1 pre-adipocyte model system: An interlaboratory study

2021· article· en· W3193694995 sur OpenAlex
Christopher D. Kassotis, Kate Hoffman, Johannes Völker, Yong Pu, Almudena Veiga-López, Stephanie Kim, Jennifer J. Schlezinger, Patrizia Bovolin, Erika Cottone, Astrid Saraceni, Rosaria Scandiffio, Ella Atlas, Karen Leingartner, Stacey L. Krager, Shelley A. Tischkau, Sibylle Ermler, Juliette Legler, Vesna A. Chappell, Suzanne E. Fenton, Fahmi Mesmar, Maria Bondesson, Mariana F. Fernández, Heather M. Stapleton

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueToxicology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueEffects and risks of endocrine disrupting chemicals
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institutes of Health
Mots-clésAdipogenesisReproducibilityAdipocyteMetabolismChemistryBiochemistryChromatographyAdipose tissue

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The 3T3-L1 murine pre-adipocyte line is an established cell culture model for screening Metabolism Disrupting Chemicals (MDCs). Despite a need to accurately identify MDCs for further evaluation, relatively little research has been performed to comprehensively evaluate reproducibility across laboratories, assess factors that might contribute to varying degrees of differentiation between laboratories (media additives, plastics, cell source, etc.), or to standardize protocols. As such, the goals of this study were to assess interlaboratory variability of efficacy and potency outcomes for triglyceride accumulation and pre-adipocyte proliferation using the mouse 3T3-L1 pre-adipocyte cell assay to test chemicals. Ten laboratories from five different countries participated. Each laboratory evaluated one reference chemical (rosiglitazone) and three blinded test chemicals (tributyltin chloride, pyraclostrobin, and bisphenol A) using: 1) their Laboratory-specific 3T3-L1 Cells (LC) and their Laboratory-specific differentiation Protocol (LP), 2) Shared 3T3-L1 Cells (SC) with LP, 3) LC with a Shared differentiation Protocol (SP), and 4) SC with SP. Blinded test chemical responses were analyzed by the coordinating laboratory. The magnitude and range of bioactivities reported varied considerably across laboratories and test conditions, though the presence or absence of activity for each tested chemical was more consistent. Triglyceride accumulation activity determinations for rosiglitazone ranged from 90 to 100% across test conditions, but 30-70 % for pre-adipocyte proliferation; this was 40-80 % for triglyceride accumulation induced by pyraclostrobin, 80-100 % for tributyltin, and 80-100 % for bisphenol A. Consistency was much lower for pre-adipocyte proliferation, with 30-70 % active determinations for pyraclostrobin, 30-50 % for tributyltin, and 20-40 % for bisphenol A. Greater consistency was observed for the SC/SP assessment. As such, working to develop a standardized adipogenic differentiation protocol represents the best strategy for improving consistency of adipogenic responses using the 3T3-L1 model to reproducibly identify MDCs and increase confidence in reported outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,290
Score d'incertitude au seuil0,560

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,376
Écart entre enseignants0,352 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle