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Enregistrement W3193850327 · doi:10.1155/2021/8909224

Detection of Circulating Tumor DNA in Patients with Thyroid Nodules

2021· article· en· W3193850327 sur OpenAlexafffund
Krupal Patel, Nicholas R. Cormier, James Fowler, Allison Partridge, Julie Theurer, Morgan Black, Nicole Pinto, John Yoo, Kevin Fung, Danielle MacNeil, William Stecho, Christopher J. Howlett, Muriel Brackstone, John W. Barrett, Anthony C. Nichols

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Endocrinology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer Genomics and Diagnostics
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesWestern University
Mots-clésMedicineThyroid nodulesThyroidThyroid cancerPathologyInternal medicineCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective. Detection of circulating tumor DNA (ctDNA) in cancer patients can potentially serve as a noninvasive, sensitive test of disease status. The purpose of this study was to determine the ability to detect BRAF (V600E) mutations in the plasma of patients with thyroid nodules, with the goal of distinguishing between benign and malignant nodules. Methods. Consecutive patients with thyroid nodules who consented for surgery were recruited. Plasma samples were obtained preoperatively and one month postoperatively. Quantitative PCR was used to determine the levels of the BRAF (V600E) mutation preoperatively and postoperatively. Results. A total of 109 patients were recruited. On final pathology, 38 (32.8%) patients had benign thyroid nodules, 45 (38.8%) had classical papillary thyroid cancer (PTC), 23 (19.8%) had nonclassical PTC, and 3 (2.6%) had follicular thyroid cancer. 15/109 patients had detectable BRAF (V600E) ctDNA in their preoperative samples—all of them having classical PTC. Higher T-stage and extrathyroidal extension in PTC were associated with positive BRAF (V600E) ctDNA ( <a:math xmlns:a="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M1"> <a:mi>p</a:mi> <a:mo>&lt;</a:mo> <a:mn>0.05</a:mn> </a:math> ). Eighty-eight pairs of preoperative and postoperative plasma samples were collected and analyzed. Of these eighty-eight paired samples, a total of 13/88 (14.8%) patients had detectable BRAF (V600E) ctDNA in their preoperative samples—all of them having classical PTC. 12 of these 13 patients had no detectable BRAF (V600E) postoperatively, while one remaining patient had a significant decline in his levels ( <c:math xmlns:c="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" id="M2"> <c:mi>p</c:mi> <c:mo>&lt;</c:mo> <c:mn>0.05</c:mn> </c:math> ). Conclusion. BRAF (V600E) circulating thyroid tumor DNA can be detected in plasma and is correlated with a final diagnosis of the classical variant of PTC. Given that a postoperative drop in BRAF (V600E) ctDNA levels was observed in all cases suggests its utility as a tumor marker.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,088
Score d'incertitude au seuil0,204

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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