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Enregistrement W3194009700 · doi:10.1002/ajmg.a.62465

Expanding the phenotype of <scp><i>ASXL3</i></scp>‐related syndrome: A comprehensive description of 45 unpublished individuals with inherited and de novo pathogenic variants in <scp><i>ASXL3</i></scp>

2021· article· en· W3194009700 sur OpenAlexaff
Schaida Schirwani, Shadi Albaba, Deanna Alexis Carere, María J. Guillen Sacoto, Francisca Milan Zamora, Yue Si, Rachel Rabin, John Pappas, Deborah L. Renaud, Natalie Hauser, Evan Reid, Patricia Blanchet, Nichola Foulds, Abhijit Dixit, Richard Fisher, Ruth Armstrong, Bertrand Isidor, Benjamin Cogné, Samantha A. Schrier Vergano, Serwet Demirdas, Natalie Dykzeul, Julie S. Cohen, Katheryn Grand, Dayna Morel Swols, Anne Slavotinek, Hessa F. Albassam, Swati Naik, John Dean, Nicola Ragge, Cinzia Costa, Maria Giovanna Tedesco, Rachel Harrison, Arjan Bouman, Emily Palen, Thomas D. Challman, Marjolein H. Willemsen, Julie Vogt, Christopher Cunniff, Katherine Bergstrom, Jagdeep S. Walia, Ange‐Line Bruel, Usha Kini, Fowzan S. Alkuraya, Valerie Slegesky, Naomi Meeks, Paula Natale Girotto, Diana Johnson, Ruth Newbury‐Ecob, Charlotte W. Ockeloen, Paolo Prontera, Sally Ann Lynch, Dong Li, John M. Graham, Tyler Mark Pierson, Meena Balasubramanian

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Rare Diseases
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesMedical Research Council
Mots-clésPhenotypeMissense mutationHypertelorismHypotoniaGeneticsBiologyIntellectual disabilityGeneBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The study aimed at widening the clinical and genetic spectrum of ASXL3-related syndrome, a neurodevelopmental disorder, caused by truncating variants in the ASXL3 gene. In this international collaborative study, we have undertaken a detailed clinical and molecular analysis of 45 previously unpublished individuals with ASXL3-related syndrome, as well as a review of all previously published individuals. We have reviewed the rather limited functional characterization of pathogenic variants in ASXL3 and discuss current understanding of the consequences of the different ASXL3 variants. In this comprehensive analysis of ASXL3-related syndrome, we define its natural history and clinical evolution occurring with age. We report familial ASXL3 pathogenic variants, characterize the phenotype in mildly affected individuals and discuss nonpenetrance. We also discuss the role of missense variants in ASXL3. We delineate a variable but consistent phenotype. The most characteristic features are neurodevelopmental delay with consistently limited speech, significant neuro-behavioral issues, hypotonia, and feeding difficulties. Distinctive features include downslanting palpebral fissures, hypertelorism, tubular nose with a prominent nasal bridge, and low-hanging columella. The presented data will inform clinical management of individuals with ASXL3-related syndrome and improve interpretation of new ASXL3 sequence variants.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,757
Score d'incertitude au seuil0,743

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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