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Enregistrement W3194211711 · doi:10.1101/2021.08.17.21261668

Cystatin C is glucocorticoid-responsive, directs recruitment of Trem2+ macrophages and predicts failure of cancer immunotherapy

2021· preprint· en· W3194211711 sur OpenAlexafffund
Sam O. Kleeman, Breanna R. Demestichas, Nicholas Mourikis, Dominik Loiero, Miriam Ferrer, Sean Bankier, Yosef Joseph Rene Amel Riazat‐Kesh, Hassal Lee, Dimitrios Chantzichristos, Claire Regan, Jonathan Preall, Sarthak Sinha, Nicole L. Rosin, Bryan G. Yipp, Luiz G. Almeida, Jeff Biernaskie, Antoine Dufour, Pinkus Tober‐Lau, Arno Ruusalepp, Johan Björkegren, Markus Ralser, Florian Kurth, Vadim Demechev, Todd Heywood, Qing Gao, Gudmundur Johannsson, Viktor H. Koelzer, Brian R. Walker, Hannah V. Meyer, Tobias Janowitz

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Kidney Disease and Diabetes
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMedical Research CouncilDirectorate for Biological SciencesSimons Center for Quantitative Biology, Cold Spring Harbor LaboratoryFundación Bancaria Caixa d'Estalvis i Pensions de BarcelonaAlberta InnovatesKillam TrustsCold Spring Harbor LaboratoryNational Institutes of HealthVetenskapsrådetSimons Foundation
Mots-clésCancerImmunotherapyCancer researchCancer immunotherapyBiologyImmunologyMedicineInternal medicinePharmacology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Cystatin C (CyC) is a secreted cysteine protease inhibitor and its biological functions remain insufficiently characterized. Plasma CyC is elevated in many patients, especially when receiving glucocorticoid (GC) treatment. Endogenous GCs are essential for life and are appropriately upregulated in response to systemic stress. Here we empirically connect GCs with systemic regulation of CyC. We used genome-wide association and structural equation modeling to determine the genetics of the latent trait CyC production in UK Biobank. CyC production and a polygenic score (PGS) capturing germline predisposition to CyC production predicted elevated all-cause and cancer-specific mortality. We then demonstrated that CyC is a direct target of GC receptor, with GC-responsive CyC secretion exhibited by macrophages and cancer cells. Using isogenic CyC-knockout tumors, we discovered a markedly attenuated tumor growth in vivo and found abrogated recruitment of Trem2+ macrophages, which have been previously linked to failure of cancer immunotherapy. Finally, we showed that the CyC-production PGS predicted checkpoint immunotherapy failure in a combined clinical trial cohort of 685 metastatic cancer patients. Taken together, our results demonstrate that CyC may be a direct effector of GC-induced immunosuppression, acting through recruitment of Trem2+ macrophages, and therefore could be a target for combination cancer immunotherapy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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