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Enregistrement W3194285750

L'analyse biochimique et génétique de la maturation et la dégradation de l'ARN

2009· article· fr· W3194285750 sur OpenAlexfundno aff
Ghada Ghazal

Notice bibliographique

RevueKnowledge UdeS (Institutional Deposit of the University of Sherbrooke) · 2009
Typearticle
Languefr
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMolecular Biology Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchTerry Fox Foundation
Mots-clésPhilosophy
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

L'expression des gènes est le conduit par lequel l'information génétique est traduite dans les phénotypes cellulaires. Récemment, il a été démontré que le programme de l'expression des gènes dans les cellules de mammifères est régi, au moins en partie par l'expression d'ARN double brin court (ARNdb). Ce mode de régulation des gènes est influencé par un grand groupe de protéines de liaison à l'ARN double brin qui peuvent soit stabiliser ou déclencher la dégradation de l'ARN double brin. En effet, les ribonucléases (RNases) spécifiques à l'ARN double brin jouent un rôle important dans l'expression des gènes. Dans la plupart des eucaryotes, les membres de la famille des RNase Ill spécifiques ~ l'ARNdb déclenchent la dégradation de l'ARN et initient la réponse immune de la cellule. Un défaut dans l'activité de la RNase Ill (DICER) inhibe l'expression des gènes et favorise le développement du cancer. D'autre part, la surexpression de la RNase Ill bloque l'infection virale. Cependant, très peu est connu sur la fonction de gestion domestique des RNases Ill chez les eucaryotes et le mécanisme par lequel ils font la distinction entre les espèces d'ARN cellulaire et l'infection \nvirale. Cette thèse pave la voie sur la manière dont les ARNdbs sont choisis pour être clivés et démontre leur contribution dans le mécanisme de l'ARN en utilisant la levure comme modèle d'étude. Initialement, les déterminants de réactivité de la RNase Ill chez la levure (Rnt1 p) ont été identifiés in vitro et utilisés pour étudier l'impact global de Rnt1 p sur la maturation des ARNs noncodants. Les résultats indiquent que Rnt1 p est nécessaire pour la maturation de tous les petits ARN nucléolaires (snoRNAs) impliqués dans la méthylation de l'ARNr et ils identifient un nouveau rôle de Rnt1 p dans la maturation des snoRNAs introniques. Il a été démontré que le clivage de Rnt1 p contribue à coordonner l'expression de certaines protéines ribosomales et des snoRNA contenus dans leurs introns. La maturation du snoRNA à partir' de l'ARN prémessager bloque l'expression du gène hôte, alors qu'en retardant la maturation du snoRNA, celle-ci se séroule sur l'intron excisé ce qui permet l'expression des deux gènes. De cette façon, la cellule peut coordonner soigneusement la quantité de protéines ribosomales et de snoRNAs requises pour la biogénèse des ribosomes. En outre, l'analyse globale de la maturation des snoRNAs a identifié de nouveaux signaux de clivage de Rnt1 p qui ne présentent pas un motif de séquence conservé.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
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Résumé présentoui

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