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Enregistrement W3194288051 · doi:10.12688/f1000research.53235.3

The role of single nucleotide polymorphisms of IL-1A -889C>T (rs1800587), TNF-A -238G>A (rs361525), and VDR TaqI (rs731236) on susceptibility to herniated nucleus pulposus: a systematic review and meta-analysis

2021· review· en· W3194288051 sur OpenAlexaboutno aff
Azharuddin Azharuddin, Muhammad Ilmawan, Jonny Karunia Fajar, Marhami Fahriani, Sukamto S. Mamada, Helnida Anggun Maliga, Firzan Nainu, Kuldeep Dhama, Harapan Harapan, Rahadyan Magetsari

Notice bibliographique

RevueF1000Research · 2021
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePregnancy-related medical research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<ns4:p> <ns4:bold>Background</ns4:bold> : The pathogenesis of herniated nucleus pulposus (HNP) is complex and may involve the wide variety of gene polymorphism. However, the reports from the existing studies are inconclusive. The objective of this study was to determine the role of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in interleukin 1 alpha ( <ns4:italic>IL-1A</ns4:italic> ), tumor necrosis factor-alpha ( <ns4:italic>TNF-A</ns4:italic> ), and vitamin D receptor ( <ns4:italic>VDR</ns4:italic> ) genes on the susceptibility to herniated nucleus pulposus (HNP). </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Methods</ns4:bold> : Four databases (PubMed, Embase, Cochrane, and Web of Science) were searched as of April 1 <ns4:sup>st</ns4:sup> , 2021. Authors, publication year, targeted genes, genotype and allele frequency in each case and control groups were collected. Newcastle-Ottawa scale was used to evaluate the publication quality. The pooled estimates of association of <ns4:italic>IL-1A</ns4:italic> -889C&gt;T (rs1800587), <ns4:italic>TNF-A</ns4:italic> -238G&gt;A (rs361525), and <ns4:italic>VDR TaqI</ns4:italic> (rs731236) and susceptibility to HNP were assessed using Z test. </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Results</ns4:bold> : We screened 3,067 unique studies for eligibility and three, two and nine case-control studies on <ns4:italic>IL-1A</ns4:italic> -889C&gt;T, <ns4:italic>TNF-A</ns4:italic> -238G&gt;A, and <ns4:italic>VDR TaqI</ns4:italic> were included, respectively, in our meta-analysis. The studies consisting 369 HNP cases and 433 controls for <ns4:italic>IL-1A</ns4:italic> -889C&gt;T, 252 cases and 259 controls for <ns4:italic>TNF-A</ns4:italic> -238G&gt;A and 1130 cases and 2096 controls for <ns4:italic>VDR TaqI.</ns4:italic> Our pooled estimates indicated that there was no significant association of those SNPs with the susceptibility to HNP in any genotype, dominant model, recessive model, or allele comparations. </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Conclusion</ns4:bold> : Although individual studies suggested the important role of gene expression dysregulation associated with SNPs in <ns4:italic>IL-1A</ns4:italic> , <ns4:italic>TNF-A</ns4:italic> , and <ns4:italic>VDR</ns4:italic> , our data indicated that <ns4:italic>IL-1A</ns4:italic> -889C&gt;T, <ns4:italic>TNF-A</ns4:italic> -238G&gt;A, and <ns4:italic>VDR TaqI</ns4:italic> had weak association with HNP susceptibility in both genotypes and allele distributions. However, since heterogeneity was identified among studies included in this meta-analysis, further meta-analysis with a larger population and subgroup analysis on specific population are warranted to support this finding. </ns4:p>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,020
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,468
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,020
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0140,003
Bibliométrie0,0010,006
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,002
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,100
Tête enseignante GPT0,393
Écart entre enseignants0,293 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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