The role of single nucleotide polymorphisms of IL-1A -889C>T (rs1800587), TNF-A -238G>A (rs361525), and VDR TaqI (rs731236) on susceptibility to herniated nucleus pulposus: a systematic review and meta-analysis
Notice bibliographique
Résumé
Background : The pathogenesis of herniated nucleus pulposus (HNP) is complex and may involve the wide variety of gene polymorphism. However, the reports from the existing studies are inconclusive. The objective of this study was to determine the role of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in interleukin 1 alpha ( IL-1A ), tumor necrosis factor-alpha ( TNF-A ), and vitamin D receptor ( VDR ) genes on the susceptibility to herniated nucleus pulposus (HNP). Methods : Four databases (PubMed, Embase, Cochrane, and Web of Science) were searched as of April 1 st , 2021. Authors, publication year, targeted genes, genotype and allele frequency in each case and control groups were collected. Newcastle-Ottawa scale was used to evaluate the publication quality. The pooled estimates of association of IL-1A -889C>T (rs1800587), TNF-A -238G>A (rs361525), and VDR TaqI (rs731236) and susceptibility to HNP were assessed using Z test. Results : We screened 3,067 unique studies for eligibility and three, two and nine case-control studies on IL-1A -889C>T, TNF-A -238G>A, and VDR TaqI were included, respectively, in our meta-analysis. The studies consisting 369 HNP cases and 433 controls for IL-1A -889C>T, 252 cases and 259 controls for TNF-A -238G>A and 1130 cases and 2096 controls for VDR TaqI. Our pooled estimates indicated that there was no significant association of those SNPs with the susceptibility to HNP in any genotype, dominant model, recessive model, or allele comparations. Conclusion : Although individual studies suggested the important role of gene expression dysregulation associated with SNPs in IL-1A , TNF-A , and VDR , our data indicated that IL-1A -889C>T, TNF-A -238G>A, and VDR TaqI had weak association with HNP susceptibility in both genotypes and allele distributions. However, since heterogeneity was identified among studies included in this meta-analysis, further meta-analysis with a larger population and subgroup analysis on specific population are warranted to support this finding.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,006 | 0,016 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,012 | 0,018 |
| Bibliométrie | 0,004 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».