Plant‐bacteria associations are phylogenetically structured in the phyllosphere
Notice bibliographique
Résumé
Determining whether and how global change will lead to novel interactions between hosts and microbes is an important issue in ecology and evolution. Understanding the contribution of host and microbial ecologies and evolutionary histories in driving their contemporary associations is an important step towards addressing this challenge and predicting the fitness consequences of novel associations. Using shotgun metagenomic and amplicon sequencing of bacterial communities from the leaf surfaces (phyllosphere) of trees, we investigated how phylogenetic relatedness among hosts and among their associated bacteria influences the distribution of bacteria among hosts. We also evaluated whether the functional traits of trees and bacteria explained these associations across multiple host species. We show that phylogenetically similar hosts tended to associate with the same bacteria and that phylogenetically similar bacteria tended to associate with the same host species. Phylogenetic interactions between tree and bacterial taxa also explained variation in their associations. The effect of host and symbiont evolutionary histories on bacterial distribution across hosts were observed across phylogenetic scales, but prominently explained variation among higher taxonomic categories of hosts and symbionts. These results suggest that ecological variation arising early in the plant and bacterial phylogenies have been particularly important for driving their contemporary associations. Variation in bacterial functional genes associated with the biosynthesis of aromatic amino acids and compounds and with cell motility were notably important in explaining bacterial community turnover among gymnosperm and angiosperm hosts. Overall, our results suggest an influence of host and bacterial traits and evolutionary histories in driving their contemporary associations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».