Genotype–Phenotype Relations in Primary Familial Brain Calcification: Systematic <scp>MDSGene</scp> Review
Notice bibliographique
Résumé
This systematic MDSGene review covers individuals with confirmed genetic forms of primary familial brain calcification (PFBC) available in the literature. Data on 516 (47% men) individuals, carrying heterozygous variants in SLC20A2 (solute carrier family 20 member 2, 61%), PDGFB (platelet-derived growth factor subunit B, 12%), XPR1 (xenotropic and polytropic retrovirus receptor, 16%), or PDGFRB (platelet-derived growth factor receptor beta, 5%) or biallelic variants in MYORG (myogenesis-regulating glycosidase, 13%) or JAM2 (junctional adhesion molecule 2, 2%), were extracted from 93 articles. Nearly one-third of the mutation carriers were clinically unaffected. Carriers of PDGFRB variants were more likely to be clinically unaffected (~54%), and the penetrance of SLC20A2 and XPR1 variants (<70%) was lower in comparison to the remaining three genes (>85%). Among the 349 clinically affected patients, 27% showed only motor and 31% only nonmotor symptoms/signs, whereas the remaining 42% had a combination thereof. While parkinsonism and speech disturbance were the most frequently reported motor manifestations, cognitive deficits, headache, and depression were the major nonmotor symptoms/signs. The basal ganglia were always calcified, and the cerebellum, thalamus, and white matter contained calcifications in 58%, 53%, and 43%, respectively, of individuals. In autosomal-dominant PFBC, mutation severity influenced the number of calcified brain areas, which in turn correlated with the clinical status, whereby the risk of developing symptoms/signs more than doubled for each additional region with calcifications. Our systematic analysis provides the most comprehensive insight into genetic, clinical, and neuroimaging features of known PFBC forms, to date. In addition, it puts forth the penetrance estimates and newly discovered genotype-phenotype relations that will improve counseling of individuals with mutations in PFBC genes. © 2021 The Authors. Movement Disorders published by Wiley Periodicals LLC on behalf of International Parkinson and Movement Disorder Society.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,010 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,004 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,011 | 0,011 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».